107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  276  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  86.96 
 
 		 139 aa  241  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  75 
 
 		 151 aa  209  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  77.44 
 
 		 150 aa  204  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  70.71 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  68.12 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  65.89 
 
 		 147 aa  183  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  68.89 
 
 		 140 aa  183  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  72.36 
 
 		 134 aa  181  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  66.67 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  71.77 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  67.42 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  72.36 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  68.18 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  70.63 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  65.93 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  70.25 
 
 		 133 aa  173  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  67.19 
 
 		 135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  68.6 
 
 		 133 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  70.97 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  60 
 
 		 135 aa  153  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  59.23 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  52.55 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  58.91 
 
 		 138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  58.91 
 
 		 138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  58.91 
 
 		 138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  59.2 
 
 		 129 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  57.36 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  50.38 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  56.59 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  56.59 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  58.2 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  50.74 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  50.74 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  57.03 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  59.5 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  47.76 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  57.89 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  52.85 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  53.28 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  51.18 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  46.92 
 
 		 143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  51.64 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  54.1 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  53.39 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  48.46 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  43.08 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  48.82 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  49.18 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  47.66 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  52.54 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  49.21 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  46.15 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  49.22 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  46.88 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  43.51 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  47.58 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  43.65 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  48.09 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  43.75 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  44.26 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  46.62 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  47.11 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  46.49 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  44.63 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  43.75 
 
 		 141 aa  103  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  44.62 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  58.56 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  39.42 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  42.54 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  39.55 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  45.61 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  41.41 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  40.48 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  39.67 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  37.98 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  38.58 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  40.65 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  40.98 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  39.45 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  43.85 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  38.84 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  36.59 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  44.74 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  41.67 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  35.16 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  35.25 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  28.81 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  35.34 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  30.16 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  34.21 
 
 		 230 aa  60.1  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  36.17 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  35.11 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  32.11 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  35.11 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  31.97 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  32.2 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>