100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0490 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 141 aa  287  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  51.45 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  51.91 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  52.21 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  51.52 
 
 		 140 aa  136  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  50.74 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  51.59 
 
 		 151 aa  133  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  50.76 
 
 		 140 aa  133  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  47.14 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  49.23 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  48.03 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  43.38 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  50.78 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  46.97 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  49.21 
 
 		 150 aa  126  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  50.38 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  46.51 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  49.21 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  49.26 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  48.41 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  47.62 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  44.44 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  40.58 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  38.13 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  44.09 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  44.09 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  44.09 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  44 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  43.2 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  40.48 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  43.31 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  42.42 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  42.74 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  40.77 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  43.31 
 
 		 130 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  39.68 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  40 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  39.68 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  37.8 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  36.15 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  35.94 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  36.43 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  37.9 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  35.48 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  40.32 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  36.69 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  37.59 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  38.58 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  37.3 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  39.34 
 
 		 134 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  37.04 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  39.84 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  35.48 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  35.77 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  34.71 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  40.48 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  33.6 
 
 		 151 aa  84.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  34.07 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  32.58 
 
 		 141 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  31.78 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  34.71 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  30.47 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  36.07 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  33.59 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  34.81 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  34.31 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  33.07 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  32.12 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  35.88 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  34.65 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  30.89 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  35.16 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  37.1 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  32.28 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  38.1 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  35.48 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  34.21 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  32.8 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  32.52 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  30.33 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  31.4 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  27.73 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  38.18 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  27.74 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  32.82 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  31.15 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  28.24 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  30.33 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  33.91 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  24.22 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  28.91 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  28.07 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  26.05 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  24.27 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  25.42 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  28.72 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  26.5 
 
 		 114 aa  42  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  30.7 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>