71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1488 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  100 
 
 		 120 aa  234  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  67.5 
 
 		 120 aa  170  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  67.5 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  67.5 
 
 		 120 aa  163  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  67.5 
 
 		 120 aa  163  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  65.83 
 
 		 120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  51.26 
 
 		 122 aa  126  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  51.26 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  52.1 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  52.94 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  45.22 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  44.64 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  45.38 
 
 		 230 aa  101  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  53.85 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  53.85 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  42.86 
 
 		 277 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  41.88 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  42.11 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  44.44 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  37.5 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  41.07 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  44.66 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  39.47 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  39.47 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  39.47 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  27.5 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  28.33 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  24.17 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  34.69 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  28.97 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  33.96 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  27.72 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  36.63 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  33.01 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  33.01 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  27.97 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2217  roadblock/LC7 domain-contain protein  28.83 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1137  roadblock/LC7 family protein  21.24 
 
 		 293 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  25.96 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  24.27 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  32.08 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  26.45 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4094  Roadblock/LC7 family protein  23.81 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  28.87 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  24.58 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  26.73 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  31.68 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  29.55 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  29.41 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  29.7 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  23.01 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0701  roadblock/LC7 family protein  32.29 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.716887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  31.33 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2155  Roadblock/LC7 family protein  24.14 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  31.58 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  28.71 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  30.95 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  28.42 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  25.96 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  32.93 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  25.42 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  27.72 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  26.72 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  28.16 
 
 		 136 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  30.95 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  25.24 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  30.95 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  42.11 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  35.9 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  23.71 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  30.95 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>