37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3233 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 123 aa  236  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  88.62 
 
 		 130 aa  217  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  52.85 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  31.71 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  30.83 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  30.83 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  30.89 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  31.71 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  28.46 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  28.33 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  27.5 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  28.33 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  33.03 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1005  roadblock/LC7 family protein  35.58 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0861653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  32.11 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1137  roadblock/LC7 family protein  25.64 
 
 		 293 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  31.18 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  31.62 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  28 
 
 		 277 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  28.83 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  28.83 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  27.87 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  35.64 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0108  roadblock/LC7 family protein  31.48 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0102077 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  28.87 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  28.87 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  29.63 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  26.45 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  35.24 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  28.87 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  28.87 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  32.35 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  28.07 
 
 		 263 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0254  hypothetical protein  31.62 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>