51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2208 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  100 
 
 		 120 aa  229  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 120 aa  229  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  68.33 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  68.33 
 
 		 120 aa  164  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  67.5 
 
 		 120 aa  163  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  63.33 
 
 		 120 aa  151  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  54.24 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  55.93 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  56.76 
 
 		 122 aa  120  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  55.86 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  48.7 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  46.09 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  46.28 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  44.54 
 
 		 230 aa  94  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  41.18 
 
 		 277 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  46.55 
 
 		 136 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  43.86 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  51.65 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  51.65 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  39.81 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  41.12 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  33.61 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  39.25 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  36.61 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  37.38 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  37.38 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  30.83 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  39.39 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  37.63 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  35.42 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  34.38 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  29.91 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2217  roadblock/LC7 domain-contain protein  30.48 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129735  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  29.09 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  29.46 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  26.85 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  31.25 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  31.25 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0254  roadblock/LC7 family protein  28.43 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  28.44 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  27.1 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  30.69 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  28.71 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  32.14 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4094  Roadblock/LC7 family protein  24 
 
 		 168 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  30.95 
 
 		 149 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1151  Roadblock/LC7 family protein  29.06 
 
 		 117 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  28.7 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  32.94 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  30.1 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  29.7 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>