57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2108 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 120 aa  234  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  97.5 
 
 		 120 aa  229  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  67.5 
 
 		 120 aa  169  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  66.67 
 
 		 120 aa  166  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  68.33 
 
 		 120 aa  164  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  68.33 
 
 		 120 aa  164  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  54.62 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  56.52 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  55.65 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  55.46 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  46.96 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  46.09 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  42.86 
 
 		 277 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  46.22 
 
 		 230 aa  100  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  45.92 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  45.92 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  41.07 
 
 		 114 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  48.42 
 
 		 141 aa  87  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  37.61 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  39.29 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  48.89 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  37.5 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  36.61 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  36.61 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  36.61 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  28.69 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2217  roadblock/LC7 domain-contain protein  32.74 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  28.33 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  28.33 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  36.56 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  32.65 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  31.19 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  32.65 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  31.36 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4094  Roadblock/LC7 family protein  28.81 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  31.09 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1137  roadblock/LC7 family protein  20 
 
 		 293 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  32.08 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  27.83 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  30.61 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0254  roadblock/LC7 family protein  31.63 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0701  roadblock/LC7 family protein  30.17 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.716887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  30.61 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  29.91 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  33.66 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  30.69 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  32.67 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  30.1 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  25.77 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1151  Roadblock/LC7 family protein  27.83 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  26.09 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  28.85 
 
 		 147 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  27.73 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  30.69 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  30.19 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  29.91 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2155  Roadblock/LC7 family protein  24.14 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>