43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3912 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 130 aa  254  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  88.62 
 
 		 123 aa  217  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  52.42 
 
 		 125 aa  131  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  29.37 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  27.5 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  29.41 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  29.37 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  29.17 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  26.02 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  28.33 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  32.74 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1137  roadblock/LC7 family protein  28.21 
 
 		 293 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  31.9 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  31.53 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  30.89 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1005  roadblock/LC7 family protein  34.29 
 
 		 223 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0861653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  35.14 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  32.11 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  27.27 
 
 		 277 aa  50.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  29.9 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  27.43 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  34.78 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  34.78 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  29.9 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0108  roadblock/LC7 family protein  29.63 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0102077 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  29.9 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  29.9 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  29.25 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  27.19 
 
 		 263 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  29.67 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  32.98 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2155  Roadblock/LC7 family protein  26.37 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  32.17 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  37.35 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  29.07 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0254  hypothetical protein  29.06 
 
 		 119 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  24.22 
 
 		 140 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  26.32 
 
 		 265 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  29.52 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  29.25 
 
 		 139 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>