36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7712 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  249  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  38.61 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  38.61 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  34.55 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  33.64 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  37.62 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  35.85 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  36.63 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  32.73 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  37.37 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  33.66 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  33.66 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  38.83 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  31.96 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  37.86 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  33.64 
 
 		 230 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  32.35 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  27.08 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  32.35 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  29.52 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1599  Roadblock/LC7 family protein  29.91 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.25658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  32.41 
 
 		 277 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  32.32 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3041  Roadblock/LC7 family protein  31.43 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  31.96 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  30.39 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  30.39 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  31.96 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  32.32 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4122  Roadblock/LC7 family protein  30.69 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  30.39 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  33.66 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  28.69 
 
 		 141 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  29.29 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  32.41 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>