25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2155 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2155  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 125 aa  251  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1617  roadblock/LC7 domain-contain protein  46.15 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1938  roadblock/LC7 family protein  37.39 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0294  roadblock/LC7 family protein  36.36 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0308  roadblock/LC7 family protein  37.39 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  32.5 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  33.73 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  30 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  30 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  30 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  25.23 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  24.3 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  28.16 
 
 		 277 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  26.37 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  24.14 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0096  Roadblock/LC7 family protein  29.91 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  25.23 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  25.23 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  25 
 
 		 120 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  24.14 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  24.14 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  25.83 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  21.28 
 
 		 125 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>