107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3668 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  70.99 
 
 
135 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  65.93 
 
 
135 aa  177  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  62.4 
 
 
129 aa  164  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  58.02 
 
 
142 aa  151  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  55.15 
 
 
139 aa  150  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  60 
 
 
136 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  59.38 
 
 
140 aa  147  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  61.48 
 
 
151 aa  147  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  55.73 
 
 
143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  54.96 
 
 
146 aa  140  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  48.92 
 
 
143 aa  140  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  59.35 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  57.38 
 
 
140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  57.38 
 
 
140 aa  136  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  56.35 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  53.68 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  53.28 
 
 
149 aa  131  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  53.49 
 
 
133 aa  131  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  54.84 
 
 
142 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  50.38 
 
 
138 aa  129  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  59.5 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  51.97 
 
 
143 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  49.25 
 
 
150 aa  121  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  49.21 
 
 
139 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  56.2 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  46.77 
 
 
133 aa  116  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  47.66 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  50.81 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  48.76 
 
 
140 aa  114  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  48.39 
 
 
134 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  62.86 
 
 
144 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  48 
 
 
135 aa  114  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  48.76 
 
 
140 aa  114  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  45.24 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  44.78 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  45.9 
 
 
133 aa  110  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  45.16 
 
 
168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  45.08 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  44.03 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  42.75 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  45.45 
 
 
148 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  46.72 
 
 
139 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  43.31 
 
 
135 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  43.44 
 
 
149 aa  106  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  50.82 
 
 
136 aa  105  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  44.26 
 
 
135 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  44.03 
 
 
140 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  42.64 
 
 
149 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  44.72 
 
 
138 aa  104  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  52.07 
 
 
152 aa  103  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  43.28 
 
 
140 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  44.35 
 
 
149 aa  103  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  44.7 
 
 
144 aa  103  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  44.44 
 
 
137 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  48.36 
 
 
141 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  42.86 
 
 
139 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  43.09 
 
 
134 aa  99.4  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  45.16 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  46.02 
 
 
130 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  39.52 
 
 
140 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  44.2 
 
 
140 aa  98.6  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  44.63 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  44.63 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  44.63 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  45.45 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  40.31 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  41.6 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  46.02 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  41.32 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  40.6 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  44.25 
 
 
137 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  39.84 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  39.2 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  41.13 
 
 
129 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  39.69 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  38.33 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  33.82 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  37.98 
 
 
136 aa  83.6  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  40.31 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  38.14 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  33.6 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  35.48 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  34.31 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  33.61 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  31.78 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  32.61 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  38.02 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  37.39 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  32.26 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  33.87 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  30.09 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  29.69 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  34.04 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
119 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  32.67 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  30.77 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  31.13 
 
 
277 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  32.67 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  30.69 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>