110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5417 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 140 aa  281  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  74.29 
 
 		 139 aa  209  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  70.71 
 
 		 139 aa  197  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  73.48 
 
 		 150 aa  193  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  70 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  63.7 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  63.7 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  59.71 
 
 		 139 aa  174  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  59.26 
 
 		 147 aa  170  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  66.94 
 
 		 134 aa  167  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  61.65 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  62.31 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  59.26 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  66.13 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  58.46 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  64.52 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  64.39 
 
 		 133 aa  164  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  61.11 
 
 		 135 aa  160  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  61.29 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  60.48 
 
 		 135 aa  156  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  60.32 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  61.48 
 
 		 140 aa  151  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  51.45 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  58.87 
 
 		 138 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  58.87 
 
 		 138 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  58.87 
 
 		 138 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  57.03 
 
 		 129 aa  143  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  52.14 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  50.37 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  51.91 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  61.95 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  56.35 
 
 		 137 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  48.89 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  49.29 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  49.28 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  53.08 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  53.08 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  45.52 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  52.24 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  48.46 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  50.41 
 
 		 140 aa  123  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  44.96 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  41.04 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  47.48 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  43.65 
 
 		 147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  44.03 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  45.04 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  45.19 
 
 		 145 aa  116  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  47.11 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  47.15 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  47.15 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  47.15 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  43.55 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 		 137 aa  110  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  47.2 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  41.79 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  42.64 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  44.8 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  47.54 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  46.72 
 
 		 140 aa  105  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  44.35 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  43.94 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  40.46 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  43.09 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  43.8 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  43.28 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  43.09 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  43.31 
 
 		 141 aa  97.1  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  39.06 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  41.8 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  39.67 
 
 		 139 aa  93.6  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  44.19 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  37.4 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  49.14 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  39.69 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  35.66 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  38.21 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  35.88 
 
 		 165 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  36.03 
 
 		 146 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  41.13 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  36.72 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  41.8 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  42.86 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  42.48 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  36.72 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  35.4 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  36.51 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  36.43 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  31.78 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  29.69 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  37.08 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  29.7 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  27.72 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  31.86 
 
 		 230 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  30.28 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  37.08 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>