43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2681 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
121 aa  231  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  63.64 
 
 
121 aa  154  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  37.72 
 
 
115 aa  84  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  36.84 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  33.66 
 
 
118 aa  60.1  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1151  Roadblock/LC7 family protein  34.48 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1376  Roadblock/LC7 family protein  34.48 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0196587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  33.66 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  34.69 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  36.56 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  35.87 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  37.63 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  37.63 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  28.83 
 
 
114 aa  51.6  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  26.79 
 
 
258 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  29.82 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  24.77 
 
 
263 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  30.7 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  34.29 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  26.67 
 
 
122 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  32.95 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  29.2 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1137  roadblock/LC7 family protein  28 
 
 
293 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  30.4 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  28.85 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  28.85 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  28.85 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  31.19 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  25 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  29.25 
 
 
150 aa  42.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  31.07 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  22.55 
 
 
265 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  30.4 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  27.62 
 
 
230 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  33 
 
 
140 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  32.04 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  26.4 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  31.07 
 
 
119 aa  40.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  26.47 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  28.44 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  31 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  25.93 
 
 
149 aa  40  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>