16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2355 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2355  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  239  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1131  hypothetical protein  48.31 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1175  roadblock/LC7 domain-contain protein  47.46 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.491956  normal  0.631453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3495  Roadblock/LC7 family protein  44.07 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000873341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1095  roadblock/LC7 family protein  44.07 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0347557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3298  Roadblock/LC7 family protein  38.14 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.958884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0963  Roadblock/LC7 family protein  37.29 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.080122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3318  hypothetical protein  36.67 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000110778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2023  hypothetical protein  31.67 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2130  hypothetical protein  27.97 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2376  roadblock/LC7 family protein  27.35 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.271407 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0980  hypothetical protein  29.17 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00944737  normal  0.121338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1822  hypothetical protein  29.09 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000209429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2025  hypothetical protein  27.27 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1594  hypothetical protein  20.18 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  23.36 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>