102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0490 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  100 
 
 		 339 aa  694    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  57.39 
 
 		 346 aa  386  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  51.33 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  56.38 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  53.39 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  52.94 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  56.85 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  55.86 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  53.35 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  53.56 
 
 		 351 aa  352  4e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  50.29 
 
 		 340 aa  351  1e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  55.99 
 
 		 346 aa  345  6e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  53.75 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  50.73 
 
 		 333 aa  335  5e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  48.83 
 
 		 333 aa  322  7e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  47.52 
 
 		 333 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  47.34 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  53.67 
 
 		 300 aa  291  8e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  44.31 
 
 		 326 aa  277  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  43.11 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  42.82 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  43.4 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  43.12 
 
 		 341 aa  264  1e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  40.47 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  40.24 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  38.76 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  38.15 
 
 		 389 aa  212  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  33.86 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  41.76 
 
 		 453 aa  202  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  33.63 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  33.83 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  31.76 
 
 		 325 aa  185  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  30.52 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  32.62 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  29.72 
 
 		 676 aa  94  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  32.33 
 
 		 992 aa  85.1  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  24.1 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  27.04 
 
 		 761 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  31.01 
 
 		 1141 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  29.58 
 
 		 1323 aa  72.8  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  30.95 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  37.63 
 
 		 552 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  30.23 
 
 		 894 aa  56.2  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  25.18 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  32.82 
 
 		 885 aa  53.9  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  25.37 
 
 		 696 aa  53.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  41.94 
 
 		 885 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  31.51 
 
 		 1004 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  32.73 
 
 		 982 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 979 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  22.62 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0459  Exo  33.58 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.454696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  27.4 
 
 		 953 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  30.68 
 
 		 1016 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 978 aa  47  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 976 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  27.48 
 
 		 643 aa  46.6  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  29.55 
 
 		 999 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3538  exonuclease IX  23.19 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  33.75 
 
 		 968 aa  45.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  50 
 
 		 950 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2058  5'-3' exonuclease  41.67 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.762247  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00080  exonuclease, putative  21.88 
 
 		 1012 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.008122  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  30.61 
 
 		 944 aa  45.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  39.62 
 
 		 843 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  24.19 
 
 		 894 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  24.83 
 
 		 912 aa  45.1  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  32.5 
 
 		 885 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  33 
 
 		 901 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  29.07 
 
 		 978 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  24.15 
 
 		 701 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  36.92 
 
 		 979 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2976  exonuclease IX  43.64 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000898265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  41.79 
 
 		 966 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  27.1 
 
 		 903 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 992 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  37.31 
 
 		 945 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  34.78 
 
 		 943 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  31.45 
 
 		 878 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  24.68 
 
 		 924 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1012  5'-3' exonuclease, putative  32.26 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  48.94 
 
 		 903 aa  43.5  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  47.92 
 
 		 976 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  31.58 
 
 		 846 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  47.83 
 
 		 928 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  44.68 
 
 		 866 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  44.68 
 
 		 866 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13291  DNA polymerase I  47.92 
 
 		 976 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  45.65 
 
 		 930 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0036  5'-3' exonuclease  42.59 
 
 		 299 aa  43.5  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.974407  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 943 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2756  exonuclease IX  29.41 
 
 		 256 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172231  normal  0.0671818 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  31.82 
 
 		 888 aa  43.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  42.86 
 
 		 936 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  41.38 
 
 		 946 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  38.33 
 
 		 1013 aa  42.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1461  5'-3' exonuclease  25.98 
 
 		 288 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1754  5'-3' exonuclease family protein  25.98 
 
 		 288 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0435319  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  40.74 
 
 		 896 aa  42.4  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  30.09 
 
 		 1000 aa  42.7  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>