204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42373 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  100 
 
 		 389 aa  801    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  51.29 
 
 		 381 aa  373  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  49.6 
 
 		 395 aa  359  5e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  46.15 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  51.89 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  40.53 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  39.2 
 
 		 346 aa  224  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  39.47 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  38.15 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  39.2 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  39.89 
 
 		 346 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  35.65 
 
 		 350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  37.69 
 
 		 346 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  37.27 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  35.76 
 
 		 338 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  35.88 
 
 		 340 aa  202  6e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  36.96 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  35.69 
 
 		 338 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  35.94 
 
 		 326 aa  196  7e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  42.56 
 
 		 300 aa  195  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  34.27 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  37.58 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  33.86 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  34.66 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  32.19 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  31.87 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  32.5 
 
 		 324 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  34.17 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  33.23 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  35.27 
 
 		 326 aa  159  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  35.09 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  35.09 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  34.97 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  32.14 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  29.3 
 
 		 330 aa  120  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  27.8 
 
 		 676 aa  93.2  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  30.18 
 
 		 761 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  26.64 
 
 		 992 aa  91.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  25.98 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  28.99 
 
 		 1141 aa  86.7  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  25.95 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  36.97 
 
 		 643 aa  74.3  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  30.94 
 
 		 866 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  30.94 
 
 		 866 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  36.36 
 
 		 1323 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00080  exonuclease, putative  28.38 
 
 		 1012 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.008122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  27.68 
 
 		 894 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  29.32 
 
 		 896 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  28.16 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 877 aa  61.2  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5068  predicted protein  27.8 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0695806  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  23.44 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  31.58 
 
 		 883 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  27.68 
 
 		 972 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  28.38 
 
 		 870 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  27.68 
 
 		 972 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  26.32 
 
 		 903 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  26.32 
 
 		 903 aa  56.6  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  29.44 
 
 		 822 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  28.35 
 
 		 924 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  25.93 
 
 		 903 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  25.86 
 
 		 872 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  42.19 
 
 		 982 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  23.39 
 
 		 944 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  30.43 
 
 		 903 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  39.51 
 
 		 950 aa  53.9  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48206  predicted protein  24.58 
 
 		 794 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.32747  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  36.84 
 
 		 879 aa  53.5  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  36.54 
 
 		 878 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  25.51 
 
 		 904 aa  53.1  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  27.65 
 
 		 896 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  27.56 
 
 		 873 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  26.56 
 
 		 878 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  38.16 
 
 		 926 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  30.15 
 
 		 912 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  27.4 
 
 		 896 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  29.85 
 
 		 917 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  26.05 
 
 		 924 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  29.07 
 
 		 939 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  30.28 
 
 		 552 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  27.68 
 
 		 934 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  28.29 
 
 		 953 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  31.34 
 
 		 868 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1666  DNA polymerase I  27.19 
 
 		 907 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0551454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  25.3 
 
 		 843 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1103  DNA polymerase I  31.5 
 
 		 861 aa  50.4  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  30.71 
 
 		 920 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  25.1 
 
 		 936 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  26.02 
 
 		 902 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  30.71 
 
 		 920 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  30.71 
 
 		 929 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  46.15 
 
 		 880 aa  50.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  33.09 
 
 		 903 aa  50.1  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  23.01 
 
 		 894 aa  50.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 886 aa  49.7  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  49.02 
 
 		 896 aa  49.7  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0459  Exo  28.81 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.454696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  29.46 
 
 		 982 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  25.4 
 
 		 933 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  44.44 
 
 		 945 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>