More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1012 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1012  5'-3' exonuclease, putative  100 
 
 		 292 aa  611  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667651  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1500  5'-3' exonuclease  75.34 
 
 		 292 aa  481  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1529  5'-3' exonuclease  75.34 
 
 		 292 aa  481  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1316  5'-3' exonuclease  53.82 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000236171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1489  5'-3' exonuclease family protein  55.56 
 
 		 288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1462  5'-3' exonuclease  55.56 
 
 		 288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1606  5'-3' exonuclease family protein  55.56 
 
 		 288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1461  5'-3' exonuclease  55.56 
 
 		 288 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1675  5'-3' exonuclease family protein  55.56 
 
 		 288 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1643  5'-3' exonuclease family protein  55.95 
 
 		 288 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0209002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1504  5'-3' exonuclease  52.17 
 
 		 288 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1707  5'-3' exonuclease  55.56 
 
 		 288 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00574418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3702  5'-3' exonuclease family protein  55.56 
 
 		 288 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00175288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1754  5'-3' exonuclease family protein  55.16 
 
 		 288 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0435319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2058  5'-3' exonuclease  50.4 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.762247  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  39.56 
 
 		 877 aa  198  7.999999999999999e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  42.19 
 
 		 877 aa  198  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  41.8 
 
 		 877 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  41.8 
 
 		 877 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  41.8 
 
 		 877 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  41.8 
 
 		 877 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  41.8 
 
 		 877 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  41.41 
 
 		 891 aa  195  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  41.41 
 
 		 891 aa  195  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  37.71 
 
 		 876 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  41.41 
 
 		 891 aa  195  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  40.94 
 
 		 883 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  42.69 
 
 		 866 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  41.8 
 
 		 877 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  42.31 
 
 		 866 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 877 aa  191  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  36.18 
 
 		 866 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  37.59 
 
 		 872 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  36.24 
 
 		 870 aa  188  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  37.84 
 
 		 879 aa  188  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 898 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  35.86 
 
 		 878 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  36.9 
 
 		 888 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 876 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 876 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  36.33 
 
 		 873 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  41.57 
 
 		 876 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  36.84 
 
 		 893 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  36.65 
 
 		 878 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  37.35 
 
 		 880 aa  178  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  36.47 
 
 		 893 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 888 aa  176  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 895 aa  175  9e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  36.59 
 
 		 917 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  35.46 
 
 		 908 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 911 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  34.66 
 
 		 909 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 929 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 920 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 920 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 892 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  32.41 
 
 		 946 aa  170  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  33.79 
 
 		 885 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  36.02 
 
 		 895 aa  169  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  33.73 
 
 		 936 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  34.13 
 
 		 950 aa  169  7e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  33.98 
 
 		 901 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  33.47 
 
 		 943 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  33.86 
 
 		 904 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 879 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 893 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  33.99 
 
 		 912 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  34.39 
 
 		 945 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 888 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 890 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  35.41 
 
 		 1273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  34.03 
 
 		 936 aa  165  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  32.81 
 
 		 973 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  34.5 
 
 		 949 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  33.22 
 
 		 891 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  33.86 
 
 		 905 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  31.53 
 
 		 891 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  33.46 
 
 		 868 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 843 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  35.29 
 
 		 896 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf613  5'-3' exonuclease, exo domain of DNA polymerase I  35.04 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  31.82 
 
 		 892 aa  162  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  34.65 
 
 		 902 aa  162  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 901 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 930 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  33.08 
 
 		 944 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  36.22 
 
 		 850 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0459  Exo  34.15 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.454696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  32.68 
 
 		 893 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  32.57 
 
 		 977 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  32.88 
 
 		 911 aa  158  8e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  31.84 
 
 		 1013 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 982 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  34.75 
 
 		 979 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  34.51 
 
 		 896 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  37.78 
 
 		 893 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  35.29 
 
 		 894 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  33.67 
 
 		 922 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  33.72 
 
 		 941 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  36.7 
 
 		 903 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>