47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0356 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  100 
 
 		 333 aa  676    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  56.16 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  54.35 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  51.95 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  49.55 
 
 		 333 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  47.34 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  50.63 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  47.69 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  45.34 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  46.9 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  46.94 
 
 		 336 aa  288  6e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  44.72 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  42.61 
 
 		 351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  43.17 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  44.72 
 
 		 349 aa  268  7e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  41.88 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  38.3 
 
 		 340 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  39.49 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  40.45 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  39.87 
 
 		 326 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  39.81 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  38.85 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  42.72 
 
 		 300 aa  219  7e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  36.78 
 
 		 341 aa  205  7e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  33.52 
 
 		 381 aa  188  9e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  34.91 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  33.33 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  31.16 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  33.44 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  34.38 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  33.23 
 
 		 389 aa  155  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  36.99 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  30.95 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  32.65 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  30.19 
 
 		 676 aa  82.8  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  23.99 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  37.07 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  32.31 
 
 		 992 aa  72.8  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  28 
 
 		 894 aa  71.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  33.59 
 
 		 1323 aa  68.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  28.19 
 
 		 1141 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  25.85 
 
 		 696 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  23.88 
 
 		 761 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  27.75 
 
 		 822 aa  53.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  22.27 
 
 		 701 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  35.37 
 
 		 552 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  25.3 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>