57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1985 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  100 
 
 		 349 aa  707    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  83.53 
 
 		 346 aa  612  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  82.66 
 
 		 346 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  80.64 
 
 		 346 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  65.62 
 
 		 350 aa  480  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  53.75 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  50.56 
 
 		 351 aa  352  7e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  52.1 
 
 		 346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  46.41 
 
 		 340 aa  311  2e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  49.71 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  45.66 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  48.52 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  48.16 
 
 		 333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  46.86 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  45.27 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  44.72 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  46.81 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  49.67 
 
 		 300 aa  272  8.000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  41.49 
 
 		 326 aa  261  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  41.38 
 
 		 324 aa  249  7e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  39.55 
 
 		 381 aa  243  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  38.04 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  38.04 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  38.35 
 
 		 324 aa  242  7e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  40.96 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  37.4 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  38.75 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  35.61 
 
 		 421 aa  212  7.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  41.39 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  34.57 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  35.28 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  34.63 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  33.53 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  34.33 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  29.68 
 
 		 676 aa  90.9  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  33.82 
 
 		 992 aa  81.3  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  25.53 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  34.78 
 
 		 1141 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  37.3 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  39.05 
 
 		 1323 aa  66.6  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  28.71 
 
 		 696 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  23.99 
 
 		 761 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  40.57 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  25 
 
 		 701 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  29.88 
 
 		 885 aa  52.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  25.98 
 
 		 822 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  33.33 
 
 		 894 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  32.12 
 
 		 643 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  25.68 
 
 		 912 aa  49.7  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  25 
 
 		 924 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  50 
 
 		 878 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  42.31 
 
 		 915 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  23.71 
 
 		 988 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  48.89 
 
 		 870 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  24.02 
 
 		 956 aa  43.9  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  35.05 
 
 		 901 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  50 
 
 		 873 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>