49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2106 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  100 
 
 		 333 aa  677    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  66.67 
 
 		 333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  62.46 
 
 		 333 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  58.86 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  51.95 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  48.83 
 
 		 338 aa  325  7e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  48.83 
 
 		 339 aa  322  7e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  48.54 
 
 		 336 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  46.8 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  46.31 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  48.8 
 
 		 350 aa  296  3e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  46.5 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  45.51 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  45.59 
 
 		 346 aa  270  4e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  44.28 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  46.81 
 
 		 349 aa  263  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  42.4 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  39.23 
 
 		 324 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  38.05 
 
 		 324 aa  228  9e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  38.05 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  38.35 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  39.51 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  35.67 
 
 		 326 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  44.13 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  37.54 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  37.24 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  36.59 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  36.5 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  35.5 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  35.9 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  37.58 
 
 		 389 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  36.02 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  40.91 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  30.49 
 
 		 421 aa  158  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  30.46 
 
 		 676 aa  81.6  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  28.27 
 
 		 761 aa  80.1  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  25.49 
 
 		 992 aa  76.6  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  34.48 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  25.2 
 
 		 1141 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  37.69 
 
 		 1323 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  31.01 
 
 		 894 aa  63.5  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  25.51 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  27.93 
 
 		 696 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  27.44 
 
 		 822 aa  55.8  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  23.2 
 
 		 894 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  36.78 
 
 		 552 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  26.76 
 
 		 333 aa  45.8  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  23.33 
 
 		 701 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02340  viral life cycle-related protein, putative  25.99 
 
 		 768 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>