58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1634 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  100 
 
 		 336 aa  687    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  54.73 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  55.62 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  52.94 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  49.14 
 
 		 350 aa  322  7e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  48.86 
 
 		 351 aa  320  3e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  48.84 
 
 		 346 aa  315  7e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  49.41 
 
 		 333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  48.54 
 
 		 333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  49.55 
 
 		 346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  44.28 
 
 		 340 aa  299  4e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  49.4 
 
 		 346 aa  299  4e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  49.14 
 
 		 349 aa  290  2e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  46.94 
 
 		 333 aa  288  7e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  45.91 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  45.61 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  48.06 
 
 		 346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  47 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  39.71 
 
 		 341 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  36.44 
 
 		 326 aa  222  6e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  36.36 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  36.66 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  36.07 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  36.07 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  37.16 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  37.27 
 
 		 381 aa  216  4e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  36.8 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  36.01 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  35.52 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  36.31 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  36.5 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  34.27 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  39.61 
 
 		 453 aa  170  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  29.95 
 
 		 421 aa  156  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  29.22 
 
 		 676 aa  82.8  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  25.23 
 
 		 992 aa  75.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  24.81 
 
 		 761 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  32.81 
 
 		 1141 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  34.15 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  28.5 
 
 		 1323 aa  65.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  27.09 
 
 		 643 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  28.08 
 
 		 894 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  28.36 
 
 		 696 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  25.95 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  26.32 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  24.25 
 
 		 894 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  36.67 
 
 		 552 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 885 aa  52.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  26.21 
 
 		 701 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  32.43 
 
 		 1004 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  26.15 
 
 		 822 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  31.25 
 
 		 979 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  31.25 
 
 		 978 aa  43.5  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  31.25 
 
 		 976 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  31.43 
 
 		 999 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  34.78 
 
 		 878 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 879 aa  42.7  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  42.86 
 
 		 885 aa  42.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>