48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0703 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  100 
 
 		 340 aa  698    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  50.29 
 
 		 339 aa  351  1e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  49.29 
 
 		 351 aa  342  5.999999999999999e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  48.26 
 
 		 346 aa  340  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  47.62 
 
 		 350 aa  325  7e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  48.66 
 
 		 346 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  43.11 
 
 		 338 aa  308  8e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  48.2 
 
 		 346 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  46.41 
 
 		 346 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  45.16 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  44.28 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  45.51 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  48.67 
 
 		 300 aa  282  5.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  41.52 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  42.11 
 
 		 333 aa  266  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  40.47 
 
 		 333 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  42.4 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  40.7 
 
 		 326 aa  256  5e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  38.3 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  39.18 
 
 		 324 aa  235  9e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  39.65 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  38.89 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  36.55 
 
 		 341 aa  229  4e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  38.6 
 
 		 324 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  38.1 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  38.02 
 
 		 381 aa  216  4e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  35.88 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  28.39 
 
 		 421 aa  168  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  36.99 
 
 		 453 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  30.09 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  30.77 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  30.88 
 
 		 325 aa  159  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  27.89 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  29.47 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  27.6 
 
 		 676 aa  84.3  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  26.85 
 
 		 696 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  26.02 
 
 		 1141 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  28.17 
 
 		 992 aa  67.4  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  25.49 
 
 		 761 aa  65.9  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  23.69 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  37.76 
 
 		 1323 aa  63.5  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  31.45 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  26.05 
 
 		 822 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  34.02 
 
 		 552 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02340  viral life cycle-related protein, putative  26.59 
 
 		 768 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  26.72 
 
 		 643 aa  50.1  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  24.24 
 
 		 894 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  22.62 
 
 		 885 aa  43.9  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>