55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3231 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  100 
 
 
325 aa  652    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  89.54 
 
 
325 aa  591  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  71.78 
 
 
326 aa  478  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  69.23 
 
 
326 aa  450  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  68.4 
 
 
325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  36.59 
 
 
338 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  35.96 
 
 
338 aa  205  8e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  37.09 
 
 
333 aa  200  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  36.76 
 
 
333 aa  192  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  34.74 
 
 
326 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  37.24 
 
 
333 aa  189  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  36.01 
 
 
336 aa  189  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  33.83 
 
 
339 aa  186  6e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  36.48 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  36.76 
 
 
346 aa  182  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  34.12 
 
 
351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  35.38 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  35.06 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  35.58 
 
 
346 aa  172  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  34.42 
 
 
324 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  33.44 
 
 
333 aa  170  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  34.09 
 
 
324 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  36.86 
 
 
346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  32.92 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  33.66 
 
 
324 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  32.48 
 
 
381 aa  159  6e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  30.88 
 
 
340 aa  159  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  33.95 
 
 
350 aa  158  9e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  34.63 
 
 
349 aa  158  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  34.58 
 
 
300 aa  147  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  30.97 
 
 
395 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  31.19 
 
 
421 aa  142  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  34.97 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  34.02 
 
 
453 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  36.29 
 
 
992 aa  79  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  31.49 
 
 
1141 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  25.6 
 
 
676 aa  72  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  33.79 
 
 
643 aa  67.4  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  34.58 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  27.5 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  32.56 
 
 
1323 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  24.3 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  26.14 
 
 
761 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  24.38 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  26.32 
 
 
912 aa  51.2  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  29.6 
 
 
894 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  34.51 
 
 
878 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  31.3 
 
 
696 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  29.71 
 
 
924 aa  46.2  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  30.43 
 
 
855 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  28.77 
 
 
873 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  32.43 
 
 
822 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  34.52 
 
 
552 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  41.27 
 
 
885 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  24.29 
 
 
894 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>