67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1081 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  100 
 
 
325 aa  654    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  89.54 
 
 
325 aa  591  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  70.55 
 
 
326 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  68.92 
 
 
326 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  67.48 
 
 
325 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  37.22 
 
 
338 aa  209  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  35.1 
 
 
338 aa  208  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  37.69 
 
 
333 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  36.39 
 
 
333 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  36.04 
 
 
333 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  37.54 
 
 
333 aa  193  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  34.42 
 
 
326 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  36.31 
 
 
336 aa  186  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  33.63 
 
 
339 aa  186  4e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  37.27 
 
 
346 aa  181  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  34.71 
 
 
351 aa  181  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  36.31 
 
 
346 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  36.86 
 
 
346 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.387412 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  33.33 
 
 
333 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  38.14 
 
 
346 aa  169  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  33.77 
 
 
324 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  34.42 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  33.44 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  33.23 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  30.77 
 
 
340 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  35.28 
 
 
349 aa  159  7e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  32.35 
 
 
324 aa  159  8e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  33.33 
 
 
350 aa  155  7e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  31.96 
 
 
381 aa  154  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  35.59 
 
 
300 aa  150  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  32.4 
 
 
421 aa  142  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  35.09 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  29.35 
 
 
395 aa  136  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  34.85 
 
 
453 aa  132  7.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  36.29 
 
 
992 aa  80.9  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  35.4 
 
 
1141 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  24.9 
 
 
676 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  32.39 
 
 
643 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  27.5 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  32.8 
 
 
1323 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  31.78 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  24.03 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  27.92 
 
 
761 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  32.56 
 
 
696 aa  52.8  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  31.21 
 
 
924 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  26.49 
 
 
894 aa  50.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  26.67 
 
 
870 aa  49.7  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  29.36 
 
 
912 aa  49.3  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  38.71 
 
 
878 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  23.46 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  29.44 
 
 
873 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  33.86 
 
 
868 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14980  DNA polymerase I  36.04 
 
 
904 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0168327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  26.42 
 
 
877 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  26.42 
 
 
877 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  26.42 
 
 
891 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  26.42 
 
 
891 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  26.42 
 
 
891 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  26.42 
 
 
877 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  26.42 
 
 
877 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  26.42 
 
 
877 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  41.94 
 
 
885 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  29.09 
 
 
894 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  32.45 
 
 
928 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  26.02 
 
 
877 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  35.71 
 
 
552 aa  42.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  33.71 
 
 
866 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>