50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46734 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  100 
 
 		 894 aa  1838    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  27.08 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  27.94 
 
 		 676 aa  77.8  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  38.55 
 
 		 214 aa  72  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  24.33 
 
 		 761 aa  71.2  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  26.32 
 
 		 333 aa  70.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  32.31 
 
 		 298 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  35.44 
 
 		 202 aa  68.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  35.12 
 
 		 201 aa  67.4  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  35.14 
 
 		 315 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  35.14 
 
 		 315 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  34.9 
 
 		 315 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27893  predicted protein  32.91 
 
 		 389 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.70309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  32.73 
 
 		 261 aa  66.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  33.86 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  32.32 
 
 		 299 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  30.77 
 
 		 292 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  32.73 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  32.48 
 
 		 201 aa  62.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  32.54 
 
 		 238 aa  59.3  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0980  3'-5' exonuclease  32.43 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4830  3'-5' exonuclease  35.9 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0991293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1697  3'-5' exonuclease  26.25 
 
 		 203 aa  57.4  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  28.96 
 
 		 325 aa  56.6  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2827  3'-5' exonuclease  29.94 
 
 		 198 aa  55.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  29.74 
 
 		 198 aa  55.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  25.42 
 
 		 341 aa  53.9  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48206  predicted protein  29.22 
 
 		 794 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.32747  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  24.25 
 
 		 336 aa  52.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  28.48 
 
 		 198 aa  52.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  23.83 
 
 		 421 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  22.16 
 
 		 333 aa  50.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  25.83 
 
 		 338 aa  50.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  30.18 
 
 		 217 aa  50.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  23.63 
 
 		 381 aa  50.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  23.2 
 
 		 333 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  23.53 
 
 		 333 aa  49.3  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  29.76 
 
 		 195 aa  48.9  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  43.86 
 
 		 389 aa  48.1  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  27.16 
 
 		 188 aa  48.1  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  24.46 
 
 		 894 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  27.57 
 
 		 326 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119559  Exodeoxyribonuclease I  27.82 
 
 		 701 aa  47  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  28.69 
 
 		 377 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  28.69 
 
 		 377 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  24.19 
 
 		 339 aa  45.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  24.76 
 
 		 395 aa  44.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  44.23 
 
 		 377 aa  44.7  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1610  3'-5' exonuclease  30.73 
 
 		 383 aa  44.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  43.86 
 
 		 377 aa  44.3  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>