95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0888 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  51.3 
 
 		 202 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  46.63 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  44.27 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  34.88 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  35.5 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  35.2 
 
 		 195 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  35.71 
 
 		 217 aa  89.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  34.22 
 
 		 298 aa  89  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1697  3'-5' exonuclease  34.12 
 
 		 203 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  34.57 
 
 		 198 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  36.63 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27893  predicted protein  34.36 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.70309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  38.18 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  38.41 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0980  3'-5' exonuclease  37.11 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2827  3'-5' exonuclease  32.62 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  35.76 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  32.76 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  31.25 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  35.76 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  35.76 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32970  ribonuclease D protein  31.95 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4830  3'-5' exonuclease  34 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0991293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  32.54 
 
 		 894 aa  59.3  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49621  predicted protein  29.49 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  31.33 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  27.65 
 
 		 377 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  32.26 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  31.61 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  31.61 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  29.34 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  26.24 
 
 		 389 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  28.48 
 
 		 377 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  27.74 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  27.27 
 
 		 409 aa  52.4  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  26.63 
 
 		 377 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  29.75 
 
 		 296 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  26.04 
 
 		 377 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  25.57 
 
 		 374 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  26.04 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  27.81 
 
 		 382 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  28.99 
 
 		 386 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  25.14 
 
 		 393 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  25.44 
 
 		 377 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30755  predicted protein  25.77 
 
 		 497 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  26.04 
 
 		 391 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  26.04 
 
 		 377 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  25.44 
 
 		 377 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05310  hypothetical protein  31.82 
 
 		 912 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  26.45 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  27.39 
 
 		 371 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  27.39 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  27.39 
 
 		 371 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  27.39 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  27.39 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  27.39 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  27.39 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  27.39 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  28.57 
 
 		 392 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  27.39 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  26.19 
 
 		 388 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  27.14 
 
 		 375 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  26.49 
 
 		 375 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  25.9 
 
 		 381 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  25.24 
 
 		 375 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  27.81 
 
 		 384 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  27.78 
 
 		 382 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  31.62 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2531  ribonuclease D  25.62 
 
 		 384 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  28.32 
 
 		 382 aa  45.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  25.95 
 
 		 375 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  25.95 
 
 		 375 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  25.95 
 
 		 375 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0869  ribonuclease D  25.28 
 
 		 391 aa  45.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0542  DNA-directed DNA polymerase  29.82 
 
 		 585 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  26.25 
 
 		 377 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  26.25 
 
 		 377 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  27.81 
 
 		 386 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  30.99 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  27.75 
 
 		 386 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  25.45 
 
 		 381 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  25.14 
 
 		 381 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  30.69 
 
 		 381 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2759  ribonuclease D  25.15 
 
 		 390 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000108089  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  29.11 
 
 		 925 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  28.33 
 
 		 382 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  25.16 
 
 		 384 aa  42.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  26.55 
 
 		 352 aa  42  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  27.91 
 
 		 204 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  24.12 
 
 		 400 aa  42  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  26.04 
 
 		 384 aa  42  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  30.71 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  24.55 
 
 		 405 aa  41.6  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>