114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3291 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 315 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  96.51 
 
 		 315 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  97.78 
 
 		 315 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  92.81 
 
 		 320 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  58.97 
 
 		 298 aa  358  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  55.17 
 
 		 299 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  54.8 
 
 		 303 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0980  3'-5' exonuclease  54.18 
 
 		 303 aa  315  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  56.03 
 
 		 261 aa  299  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  39.09 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  35.23 
 
 		 188 aa  101  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  43.24 
 
 		 201 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  34.59 
 
 		 198 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  32.45 
 
 		 198 aa  92.8  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  36.21 
 
 		 195 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  38.82 
 
 		 201 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  40 
 
 		 202 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2827  3'-5' exonuclease  36.25 
 
 		 198 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  34.04 
 
 		 214 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  34.13 
 
 		 217 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 238 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4830  3'-5' exonuclease  37.66 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0991293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1697  3'-5' exonuclease  32.45 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  34.71 
 
 		 894 aa  73.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27893  predicted protein  30.57 
 
 		 389 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.70309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  31.52 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  28.65 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  28.24 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  29.21 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  30.92 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  27.33 
 
 		 382 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  29.28 
 
 		 400 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  33.08 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  31.08 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  32.33 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  32.33 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  27.78 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  29.45 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  28.22 
 
 		 384 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  31.08 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  30.25 
 
 		 377 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32970  ribonuclease D protein  31.76 
 
 		 375 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  28.12 
 
 		 295 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  30.86 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  32.85 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  27.67 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  27.71 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  25.27 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  29.27 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  28.14 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  30.13 
 
 		 381 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  27.62 
 
 		 395 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  26.55 
 
 		 409 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  30.3 
 
 		 374 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  30.57 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  31.61 
 
 		 358 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  26.88 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  27.44 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  27.27 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  31.01 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  26.88 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  27.17 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2088  ribonuclease D  30.92 
 
 		 362 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227904  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  28.57 
 
 		 392 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  26.88 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  30.6 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  26.88 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  26.06 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2009  ribonuclease D  30.92 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  26.32 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  26.38 
 
 		 384 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  30.51 
 
 		 385 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  26.83 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1064  ribonuclease D (rnase d)  28.65 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409138  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49621  predicted protein  27.43 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  29.66 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30755  predicted protein  26.2 
 
 		 497 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  29.66 
 
 		 385 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  27.49 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  29.32 
 
 		 393 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  26.49 
 
 		 384 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  26.49 
 
 		 384 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  26.49 
 
 		 388 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  32.61 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  28.97 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  30.32 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  25.95 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  27.17 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0672  Ribonuclease D  27.1 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1610  3'-5' exonuclease  29.22 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533574  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  24.85 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  27.07 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  27.33 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  26.22 
 
 		 395 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  26.83 
 
 		 368 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  33.98 
 
 		 211 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  28.57 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  28.89 
 
 		 386 aa  43.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  24.64 
 
 		 383 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  32.56 
 
 		 204 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>