24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_93442 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  100 
 
 
389 aa  793    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05310  hypothetical protein  34.27 
 
 
912 aa  64.7  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  27.88 
 
 
188 aa  61.6  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  29.03 
 
 
202 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  28.76 
 
 
214 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  27.32 
 
 
198 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  30.18 
 
 
303 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  27.38 
 
 
198 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  26.24 
 
 
238 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  29.59 
 
 
299 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  27.42 
 
 
201 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  32.45 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  26.52 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  31.06 
 
 
195 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  28.65 
 
 
315 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  28.65 
 
 
315 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  43.86 
 
 
894 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24216  predicted protein  27.03 
 
 
614 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000105574  normal  0.257182 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  28.65 
 
 
315 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  30.2 
 
 
261 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  26.34 
 
 
201 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  27.5 
 
 
217 aa  46.6  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  30.11 
 
 
320 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0542  DNA-directed DNA polymerase  32.65 
 
 
585 aa  45.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>