66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1397 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  41.3 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  37.57 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  38.1 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2827  3'-5' exonuclease  39.15 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1697  3'-5' exonuclease  38.62 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4830  3'-5' exonuclease  38.02 
 
 		 294 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0991293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  37.64 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  36.52 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  35.96 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  36.46 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  35.2 
 
 		 238 aa  91.7  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  37.42 
 
 		 303 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  35.67 
 
 		 292 aa  88.2  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  37.42 
 
 		 299 aa  87.8  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  34.78 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  35.1 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0980  3'-5' exonuclease  36.11 
 
 		 303 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  30.29 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  36.21 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  36.21 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  36.21 
 
 		 315 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  35.03 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  28.12 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  27.54 
 
 		 377 aa  62  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  27.54 
 
 		 377 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  29.38 
 
 		 925 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  29.38 
 
 		 925 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1610  3'-5' exonuclease  24.49 
 
 		 383 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  25.81 
 
 		 375 aa  51.6  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30755  predicted protein  30.86 
 
 		 497 aa  51.6  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  31.06 
 
 		 389 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  29.76 
 
 		 894 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  21.43 
 
 		 295 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  28.48 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2088  ribonuclease D  27.63 
 
 		 362 aa  48.9  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227904  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  26.06 
 
 		 393 aa  48.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  27.46 
 
 		 396 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  22.67 
 
 		 393 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24216  predicted protein  26.67 
 
 		 614 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000105574  normal  0.257182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  28.57 
 
 		 288 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  25.99 
 
 		 377 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  30.68 
 
 		 382 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  28.57 
 
 		 294 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2009  ribonuclease D  26.97 
 
 		 362 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  27.89 
 
 		 288 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  25.31 
 
 		 377 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  24.5 
 
 		 358 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  25.17 
 
 		 382 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  27.34 
 
 		 381 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  26.42 
 
 		 381 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  26.55 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0672  Ribonuclease D  23.38 
 
 		 423 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  24.69 
 
 		 377 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0542  DNA-directed DNA polymerase  33.96 
 
 		 585 aa  43.1  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  22.09 
 
 		 374 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  24.82 
 
 		 379 aa  42.4  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32970  ribonuclease D protein  25.31 
 
 		 375 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789666  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  25.45 
 
 		 377 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  26.23 
 
 		 209 aa  42  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  25.45 
 
 		 377 aa  42  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  29.81 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  26.25 
 
 		 367 aa  41.6  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  25.45 
 
 		 377 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  25 
 
 		 381 aa  41.6  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  23.21 
 
 		 392 aa  41.2  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>