283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3636 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 381 aa  768    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  53.93 
 
 		 382 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  48.64 
 
 		 409 aa  359  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  49.05 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  47.7 
 
 		 381 aa  333  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  45.55 
 
 		 377 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  45.28 
 
 		 377 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  44.32 
 
 		 375 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  42.2 
 
 		 382 aa  299  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  40.66 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  41.01 
 
 		 288 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  40.65 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  40.65 
 
 		 288 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  37.19 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  38.51 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  32.4 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2402  ribonuclease D  32.63 
 
 		 373 aa  154  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2013  ribonuclease D  32.63 
 
 		 373 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000328628  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2124  ribonuclease D  32.63 
 
 		 373 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0137564  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  30.82 
 
 		 388 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1937  ribonuclease D  30.38 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2232  ribonuclease D  29.52 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000142967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  30.38 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  32.08 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  29.61 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  29.61 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  29.61 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  27.36 
 
 		 386 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  30.98 
 
 		 396 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  29.31 
 
 		 375 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  29.31 
 
 		 375 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  28.66 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1994  ribonuclease D  28.61 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  29 
 
 		 375 aa  135  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  28.7 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  30 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  28.7 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  28.7 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  28.7 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  28.7 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  28.7 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  30.33 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  31.58 
 
 		 374 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  31.23 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  28.75 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  28.75 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  29 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  29.69 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  29.36 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  31.21 
 
 		 377 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  30.77 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2759  ribonuclease D  30.42 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000108089  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  27.99 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  29.19 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  28.87 
 
 		 381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  28.46 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  29.12 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  30.91 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  29.15 
 
 		 383 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2009  ribonuclease D  27.94 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  30.61 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  30.06 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  30.79 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  29.11 
 
 		 368 aa  123  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  29.03 
 
 		 381 aa  122  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  28.11 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  28.85 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1064  ribonuclease D (rnase d)  28.4 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  31.27 
 
 		 408 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  28.96 
 
 		 416 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  29.23 
 
 		 442 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0672  Ribonuclease D  26.71 
 
 		 423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  27.39 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  27.93 
 
 		 392 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  28.3 
 
 		 392 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  27.39 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  32.84 
 
 		 403 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  28.12 
 
 		 399 aa  118  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05001  exosome complex exonuclease Rrp6, putative (Eurofung)  31.82 
 
 		 1297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333756  normal  0.453331 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  29.45 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  28.99 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  30.87 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  29.69 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  27.75 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  27.38 
 
 		 369 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  29.82 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  36 
 
 		 431 aa  116  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  27.79 
 
 		 384 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  28.76 
 
 		 388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  28.34 
 
 		 389 aa  116  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  29.57 
 
 		 386 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68661  ribosomal RNA processing 3'-5' exonuclease  30.11 
 
 		 792 aa  115  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  26.06 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2531  ribonuclease D  28.34 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  26.9 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  29.23 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  28.57 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32970  ribonuclease D protein  31.67 
 
 		 375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789666  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  27.34 
 
 		 385 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  29.87 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>