228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68661 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_68661  ribosomal RNA processing 3'-5' exonuclease  100 
 
 		 792 aa  1635    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05001  exosome complex exonuclease Rrp6, putative (Eurofung)  36.76 
 
 		 1297 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333756  normal  0.453331 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03940  PM-scl autoantigen, putative  38.37 
 
 		 1016 aa  273  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39090  predicted protein  47.59 
 
 		 176 aa  171  6e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22703  predicted protein  44.62 
 
 		 311 aa  159  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0386585  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  33.46 
 
 		 295 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  47.37 
 
 		 382 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  31.33 
 
 		 377 aa  125  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  31.65 
 
 		 377 aa  124  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  30.11 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  33.85 
 
 		 294 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  29.87 
 
 		 409 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  36.26 
 
 		 288 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  36.26 
 
 		 288 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  31.03 
 
 		 375 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  37.65 
 
 		 382 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  33.82 
 
 		 296 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  35.47 
 
 		 382 aa  105  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  37.65 
 
 		 381 aa  104  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45692  predicted protein  33.78 
 
 		 700 aa  103  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  26.28 
 
 		 396 aa  100  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  27.04 
 
 		 379 aa  96.7  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  26.64 
 
 		 392 aa  95.1  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  26.87 
 
 		 393 aa  91.3  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  28.65 
 
 		 392 aa  89  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  25.59 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  31.98 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  27.17 
 
 		 413 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  31.61 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  25.63 
 
 		 499 aa  84.7  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  30.54 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0300  putative ribonuclease D  29.15 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  31.74 
 
 		 392 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  25.53 
 
 		 396 aa  83.2  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  26.03 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  32.18 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  26.85 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  29.05 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  30.81 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  26.71 
 
 		 385 aa  80.1  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  27.11 
 
 		 389 aa  80.1  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  30.46 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  30.23 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  23.64 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  26.48 
 
 		 377 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  31.82 
 
 		 352 aa  77  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  30.77 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  30.99 
 
 		 388 aa  76.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  26.51 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  26.33 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  30.46 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  28.36 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  30.46 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  24.1 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  28.83 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  29.94 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  26.94 
 
 		 386 aa  73.9  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  26.09 
 
 		 421 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  30.99 
 
 		 394 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  24.64 
 
 		 393 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  33.55 
 
 		 389 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1994  ribonuclease D  25.28 
 
 		 373 aa  73.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2531  ribonuclease D  25.65 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  30.59 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  27.37 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  25.77 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  24.28 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  27.02 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  21.22 
 
 		 386 aa  70.1  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  30.99 
 
 		 395 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  29.94 
 
 		 383 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2009  ribonuclease D  22.19 
 
 		 403 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  30.81 
 
 		 385 aa  69.7  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  24.45 
 
 		 369 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  25.09 
 
 		 392 aa  70.1  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  26.24 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  23.62 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  27.13 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  24.83 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  30.61 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  27.33 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  30.99 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  22.62 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  33.55 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  22.97 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  33.55 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  24.84 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  27.24 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  23.55 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  28.74 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  23.55 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  28.14 
 
 		 381 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  23.7 
 
 		 377 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  27.89 
 
 		 385 aa  67.4  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  27.65 
 
 		 451 aa  67  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  28.74 
 
 		 382 aa  66.6  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  23.36 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  25.27 
 
 		 386 aa  66.6  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  22.85 
 
 		 369 aa  66.6  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  22.65 
 
 		 384 aa  66.6  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>