217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2832 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 421 aa  825    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1901  HRDC:3'-5' exonuclease  72.7 
 
 		 420 aa  538  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  64.9 
 
 		 437 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  64.57 
 
 		 408 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  64.03 
 
 		 403 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  60.46 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  60 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  57.11 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  59.08 
 
 		 420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  57.54 
 
 		 437 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  56.71 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6780  3'-5' exonuclease  53.69 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  57.8 
 
 		 451 aa  405  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  54.31 
 
 		 413 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  58.06 
 
 		 414 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  58.33 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3921  3'-5' exonuclease  54.05 
 
 		 424 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0599222  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  55.13 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1649  3'-5' exonuclease  54.9 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1656  3'-5' exonuclease  53.73 
 
 		 449 aa  381  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.290963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2479  3'-5' exonuclease  53.87 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1962  3'-5' exonuclease  61.26 
 
 		 416 aa  378  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.128564  hitchhiker  0.0000452801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1726  3'-5' exonuclease  59.24 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0339876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  52.59 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  60.68 
 
 		 427 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1890  3'-5' exonuclease  49.87 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2261  3'-5' exonuclease  53.88 
 
 		 447 aa  343  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2210  3'-5' exonuclease  49.88 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2256  3'-5' exonuclease  49.88 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2199  3'-5' exonuclease  49.88 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10077 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  51.61 
 
 		 416 aa  330  4e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  49.02 
 
 		 431 aa  329  6e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12696  hypothetical protein  49.16 
 
 		 438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000231151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0690  ribonuclease D  43.06 
 
 		 433 aa  302  7.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00562045  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1392  3'-5' exonuclease  45.06 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125783  normal  0.298063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  47.83 
 
 		 399 aa  292  6e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0883  3'-5' exonuclease  48.04 
 
 		 476 aa  249  5e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  36.58 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  34.57 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  31.12 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  32.47 
 
 		 382 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  34.19 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  32.76 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  30.03 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  39.08 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  30.19 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  38.7 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  37.93 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  30.49 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  36.3 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  33.66 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  33.78 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  29.73 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  29.69 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  31.36 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  33.8 
 
 		 384 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  33.8 
 
 		 384 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  34.63 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  30.64 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  32.77 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  31.58 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  31.29 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  33.33 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1890  ribonuclease D  32.24 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239057  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  32.09 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  32.36 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  31.85 
 
 		 295 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  33.33 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  33.73 
 
 		 392 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  31.19 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  33.33 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  33.2 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  33.78 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  28.7 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  30.8 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  32.19 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  34.57 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  31.93 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  31.27 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  32.49 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  29.7 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  32.35 
 
 		 396 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  30.88 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  31.6 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  29.7 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  28.98 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  29.37 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  33.33 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  34.66 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  32.92 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  31.06 
 
 		 384 aa  99.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  32.83 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  30.22 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  32.5 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  33.48 
 
 		 382 aa  97.4  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  30.77 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3068  ribonuclease D  30.11 
 
 		 385 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  31.02 
 
 		 377 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  31.02 
 
 		 377 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  34.29 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>