240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2266 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 403 aa  782    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  75.25 
 
 		 408 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  68.78 
 
 		 437 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  64.03 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1901  HRDC:3'-5' exonuclease  68.5 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  62.98 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  60.68 
 
 		 499 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  63.02 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  62.24 
 
 		 451 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  58.08 
 
 		 416 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  60.2 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6780  3'-5' exonuclease  57.35 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  59.19 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  58.44 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  57.4 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  57.03 
 
 		 442 aa  401  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2479  3'-5' exonuclease  57.83 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  60.82 
 
 		 427 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3921  3'-5' exonuclease  54.68 
 
 		 424 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0599222  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1656  3'-5' exonuclease  57.47 
 
 		 449 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.290963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  58.25 
 
 		 407 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1726  3'-5' exonuclease  61.3 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0339876 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1649  3'-5' exonuclease  55.93 
 
 		 443 aa  378  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1962  3'-5' exonuclease  59.54 
 
 		 416 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.128564  hitchhiker  0.0000452801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  61.78 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1890  3'-5' exonuclease  51.91 
 
 		 404 aa  363  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2261  3'-5' exonuclease  55.78 
 
 		 447 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2210  3'-5' exonuclease  54.77 
 
 		 428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2256  3'-5' exonuclease  54.77 
 
 		 428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2199  3'-5' exonuclease  54.77 
 
 		 428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12696  hypothetical protein  51.57 
 
 		 438 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000231151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  52.23 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1392  3'-5' exonuclease  47.72 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125783  normal  0.298063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  48.9 
 
 		 431 aa  311  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  48.6 
 
 		 399 aa  295  7e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0690  ribonuclease D  41.98 
 
 		 433 aa  279  6e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00562045  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0883  3'-5' exonuclease  45.32 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  33.99 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  35.2 
 
 		 396 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  40.38 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  40 
 
 		 288 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  39.25 
 
 		 294 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  32.99 
 
 		 409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  35.42 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  34.71 
 
 		 381 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  31.17 
 
 		 369 aa  132  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  32.05 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  30.05 
 
 		 381 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  33.78 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  32.84 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  32.47 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  33.14 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  34.78 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  31.97 
 
 		 384 aa  126  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  31.97 
 
 		 384 aa  126  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  30.48 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  31.83 
 
 		 367 aa  123  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  31.17 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  31.1 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  31.1 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  31.1 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  31.71 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  31.97 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  37.14 
 
 		 296 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  33.66 
 
 		 389 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  32.5 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  31.63 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  31.35 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  32.8 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  33.74 
 
 		 352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  34.36 
 
 		 391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  30.09 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  34.06 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  30.09 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  34.48 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  32.07 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  29.8 
 
 		 385 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  34.23 
 
 		 295 aa  113  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1734  ribonuclease D  31.73 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  35.21 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  33.45 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  32.88 
 
 		 379 aa  110  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  28.82 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  30.91 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  30.29 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  32.87 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  32.87 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  31.82 
 
 		 393 aa  106  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  28.75 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1626  ribonuclease D  30.22 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000103666  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  33.09 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  33.33 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  33.01 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  32.12 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  32.48 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  32.12 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  31.49 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  31.49 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  31.49 
 
 		 371 aa  103  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  31.49 
 
 		 375 aa  103  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>