143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45692 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45692  predicted protein  100 
 
 		 700 aa  1456    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  40.35 
 
 		 382 aa  111  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03940  PM-scl autoantigen, putative  37.16 
 
 		 1016 aa  110  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68661  ribosomal RNA processing 3'-5' exonuclease  33.78 
 
 		 792 aa  104  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  42.28 
 
 		 377 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  42.28 
 
 		 377 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  34.68 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  41.06 
 
 		 409 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  36.87 
 
 		 381 aa  97.4  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  34.44 
 
 		 295 aa  94  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  35.84 
 
 		 381 aa  93.2  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05001  exosome complex exonuclease Rrp6, putative (Eurofung)  34.32 
 
 		 1297 aa  91.3  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333756  normal  0.453331 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39090  predicted protein  37.5 
 
 		 176 aa  90.1  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  37.89 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  34.04 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  36.54 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  35.16 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  35.16 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  32.79 
 
 		 296 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  34.62 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22703  predicted protein  29.81 
 
 		 311 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0386585  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  29.69 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1962  3'-5' exonuclease  30.63 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.128564  hitchhiker  0.0000452801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  31.02 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  27.66 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  29.89 
 
 		 399 aa  63.9  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  32.52 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  28.57 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  29.66 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  27.47 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0690  ribonuclease D  31.52 
 
 		 433 aa  62  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00562045  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  26.46 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  30.77 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  28.19 
 
 		 451 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  24.86 
 
 		 383 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  30.19 
 
 		 206 aa  59.7  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  29.11 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  28.73 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  29.53 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1726  3'-5' exonuclease  27.27 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0339876 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1392  3'-5' exonuclease  28.57 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125783  normal  0.298063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  28.18 
 
 		 925 aa  57.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  28.42 
 
 		 384 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  28.18 
 
 		 925 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  28.02 
 
 		 394 aa  57  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  30.19 
 
 		 392 aa  56.2  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  25.49 
 
 		 352 aa  56.2  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  29.45 
 
 		 403 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  29.35 
 
 		 385 aa  55.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  28.86 
 
 		 427 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  27.96 
 
 		 393 aa  55.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  28.12 
 
 		 442 aa  54.7  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  26.9 
 
 		 421 aa  54.7  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  26.78 
 
 		 382 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  26.58 
 
 		 427 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  29.7 
 
 		 405 aa  53.5  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  27.68 
 
 		 358 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  31.72 
 
 		 210 aa  53.5  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  28.8 
 
 		 385 aa  53.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1901  HRDC:3'-5' exonuclease  26.32 
 
 		 420 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  26.49 
 
 		 389 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  29.61 
 
 		 206 aa  53.1  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2261  3'-5' exonuclease  28.57 
 
 		 447 aa  53.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  29.53 
 
 		 437 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1656  3'-5' exonuclease  27.11 
 
 		 449 aa  52.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.290963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  26.32 
 
 		 382 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  28.21 
 
 		 407 aa  52  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  28.8 
 
 		 385 aa  52  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  27.72 
 
 		 386 aa  51.6  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  29.14 
 
 		 392 aa  51.6  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0300  putative ribonuclease D  29.67 
 
 		 387 aa  51.2  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  26.84 
 
 		 416 aa  51.2  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  26.84 
 
 		 392 aa  51.2  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  29.56 
 
 		 379 aa  50.8  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  28.29 
 
 		 204 aa  51.2  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  27.47 
 
 		 392 aa  50.8  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  27.86 
 
 		 369 aa  50.8  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  27.1 
 
 		 205 aa  50.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  25.67 
 
 		 384 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2009  ribonuclease D  26.6 
 
 		 403 aa  50.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  27.1 
 
 		 205 aa  49.7  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0883  3'-5' exonuclease  36.05 
 
 		 476 aa  49.7  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  27.1 
 
 		 205 aa  49.7  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  29.49 
 
 		 209 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  25.71 
 
 		 381 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32970  ribonuclease D protein  31.82 
 
 		 375 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.789666  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  29.45 
 
 		 377 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  28.74 
 
 		 385 aa  48.9  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  30.2 
 
 		 207 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  28.66 
 
 		 377 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  28.09 
 
 		 386 aa  48.5  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  28.76 
 
 		 206 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  26.63 
 
 		 396 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  28.93 
 
 		 377 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  24.54 
 
 		 414 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  29.41 
 
 		 393 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  24.84 
 
 		 205 aa  47.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  25.57 
 
 		 392 aa  47.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6780  3'-5' exonuclease  25.31 
 
 		 443 aa  47.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  26.32 
 
 		 392 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>