198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0690 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0690  ribonuclease D  100 
 
 		 433 aa  879    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00562045  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0883  3'-5' exonuclease  58.74 
 
 		 476 aa  560  1e-158  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  44.92 
 
 		 420 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  43.06 
 
 		 421 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  42.92 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1901  HRDC:3'-5' exonuclease  41.2 
 
 		 420 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1656  3'-5' exonuclease  41.36 
 
 		 449 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.290963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  41.67 
 
 		 499 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2479  3'-5' exonuclease  39.53 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1649  3'-5' exonuclease  41.65 
 
 		 443 aa  262  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  38.82 
 
 		 437 aa  262  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  41.65 
 
 		 403 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3921  3'-5' exonuclease  39.35 
 
 		 424 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0599222  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  38.46 
 
 		 413 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6780  3'-5' exonuclease  37.73 
 
 		 443 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1726  3'-5' exonuclease  40.1 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0339876 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1392  3'-5' exonuclease  36.68 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125783  normal  0.298063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  41.05 
 
 		 408 aa  253  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  39.42 
 
 		 418 aa  252  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  40.1 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  39.68 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  37.62 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1890  3'-5' exonuclease  39.1 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  39.2 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1962  3'-5' exonuclease  41.25 
 
 		 416 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.128564  hitchhiker  0.0000452801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2210  3'-5' exonuclease  39.17 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2256  3'-5' exonuclease  39.17 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2199  3'-5' exonuclease  39.17 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  39.18 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  40.84 
 
 		 416 aa  243  5e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  38.64 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  37.97 
 
 		 442 aa  235  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12696  hypothetical protein  35.33 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000231151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  37.01 
 
 		 431 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2261  3'-5' exonuclease  38.72 
 
 		 447 aa  230  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  39.34 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  46.24 
 
 		 427 aa  216  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  30.82 
 
 		 382 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  29.19 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  29.84 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  31.4 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  31.73 
 
 		 368 aa  99.8  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  31.08 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  31.08 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  33.48 
 
 		 369 aa  97.8  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  28.11 
 
 		 382 aa  97.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  30.15 
 
 		 391 aa  97.1  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  31.37 
 
 		 388 aa  95.5  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  26.5 
 
 		 409 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  28.26 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  31.74 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  31.3 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  31.89 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  31.89 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  27.27 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  29.15 
 
 		 295 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  31.5 
 
 		 371 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  31.1 
 
 		 388 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  31.72 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  30.77 
 
 		 396 aa  87.8  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1734  ribonuclease D  30.71 
 
 		 370 aa  87  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  31.1 
 
 		 369 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2232  ribonuclease D  29.72 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000142967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  30.71 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  30.71 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  30.71 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  30.35 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  28.3 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  30.74 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1937  ribonuclease D  30.07 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  29.53 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  30.35 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  27.59 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  29.58 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  29.35 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  33.7 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  25.81 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1626  ribonuclease D  29.73 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000103666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  29.03 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  29.03 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  29.03 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2009  ribonuclease D  29.43 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1461  ribonuclease D  27.45 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  27.96 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0507  ribonuclease D  28.52 
 
 		 374 aa  76.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  28.2 
 
 		 379 aa  76.3  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  28.67 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  28.67 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  28.67 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  28.67 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  28.67 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  28.67 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  28.32 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  28.32 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  28.32 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  28.32 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  28.32 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  29.93 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  29.93 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  29.93 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>