229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6780 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6780  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 443 aa  866    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  59.46 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  58.21 
 
 		 408 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  57.32 
 
 		 499 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  55.86 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  53.69 
 
 		 421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  56.02 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  56.86 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  56.03 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  55.4 
 
 		 442 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  56.62 
 
 		 403 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  57.04 
 
 		 414 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1901  HRDC:3'-5' exonuclease  53.88 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1726  3'-5' exonuclease  57.86 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0339876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  56.54 
 
 		 427 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3921  3'-5' exonuclease  49.07 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0599222  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  54.05 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1649  3'-5' exonuclease  50.12 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1656  3'-5' exonuclease  50.47 
 
 		 449 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.290963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1962  3'-5' exonuclease  58.94 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.128564  hitchhiker  0.0000452801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  54.05 
 
 		 451 aa  363  4e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  52.21 
 
 		 416 aa  362  9e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2479  3'-5' exonuclease  49.25 
 
 		 426 aa  351  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  53.32 
 
 		 407 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  60.55 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1890  3'-5' exonuclease  46.99 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2261  3'-5' exonuclease  48.64 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2210  3'-5' exonuclease  48.46 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2256  3'-5' exonuclease  48.46 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2199  3'-5' exonuclease  48.46 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10077 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  51.09 
 
 		 416 aa  329  7e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  48.84 
 
 		 431 aa  323  4e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12696  hypothetical protein  48.41 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000231151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1392  3'-5' exonuclease  43.6 
 
 		 406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125783  normal  0.298063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  46.77 
 
 		 399 aa  292  8e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0690  ribonuclease D  37.73 
 
 		 433 aa  263  4e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00562045  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0883  3'-5' exonuclease  41.72 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  30.83 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  30.84 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  32.14 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  34.19 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  36.52 
 
 		 296 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  36.04 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  35.69 
 
 		 288 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  35.34 
 
 		 288 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  28.66 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  29.11 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  29.11 
 
 		 377 aa  106  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  28.35 
 
 		 381 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  31.56 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  33.21 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  30.29 
 
 		 392 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  32.19 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  32.71 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  32.98 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  33.33 
 
 		 394 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  27.2 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  33.09 
 
 		 384 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  29.33 
 
 		 295 aa  98.2  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  33.09 
 
 		 384 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  30.28 
 
 		 381 aa  96.7  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  29.57 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  30.6 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  32.75 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  27.03 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  27.03 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  29.25 
 
 		 379 aa  94  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  27.19 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  29.15 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  27.19 
 
 		 367 aa  92.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  29.02 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  33.16 
 
 		 405 aa  91.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1752  ribonuclease D  28.13 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00607213  normal  0.281233 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  31.35 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1461  ribonuclease D  30.75 
 
 		 375 aa  90.5  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  31.29 
 
 		 385 aa  90.1  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  28.61 
 
 		 371 aa  90.5  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  28.57 
 
 		 369 aa  90.1  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1971  ribonuclease D  28.9 
 
 		 385 aa  89.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0679  ribonuclease D  28.9 
 
 		 385 aa  89.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  32.26 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  26.38 
 
 		 352 aa  89.7  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  26.97 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  28.24 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  32.01 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1626  ribonuclease D  30 
 
 		 371 aa  89  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000103666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  31.91 
 
 		 377 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  31.8 
 
 		 377 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  26.06 
 
 		 368 aa  87  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  31.23 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  31.21 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1890  ribonuclease D  30.42 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239057  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3068  ribonuclease D  27.78 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  31.12 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  29.12 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  29.12 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  29.12 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  27.96 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  30.63 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  30.63 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>