235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5178 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 499 aa  967    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  78.93 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  62.5 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  60.71 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  63.66 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  60.66 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  59.45 
 
 		 408 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  59.8 
 
 		 421 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1901  HRDC:3'-5' exonuclease  58.38 
 
 		 420 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  58.77 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  59.95 
 
 		 403 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6780  3'-5' exonuclease  56.45 
 
 		 443 aa  415  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  56.4 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  56.93 
 
 		 451 aa  405  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  55.42 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  56.25 
 
 		 420 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2261  3'-5' exonuclease  55.82 
 
 		 447 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3921  3'-5' exonuclease  52.7 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0599222  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1726  3'-5' exonuclease  57.44 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0339876 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1890  3'-5' exonuclease  52.79 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1656  3'-5' exonuclease  53.13 
 
 		 449 aa  375  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.290963  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  53.32 
 
 		 416 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2479  3'-5' exonuclease  51.33 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1649  3'-5' exonuclease  51.73 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1962  3'-5' exonuclease  58.4 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.128564  hitchhiker  0.0000452801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  54.14 
 
 		 407 aa  365  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2210  3'-5' exonuclease  51.92 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2256  3'-5' exonuclease  51.92 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2199  3'-5' exonuclease  51.92 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12696  hypothetical protein  51.18 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000231151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  58.29 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  53.32 
 
 		 416 aa  336  5.999999999999999e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  49.18 
 
 		 431 aa  333  4e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1392  3'-5' exonuclease  43.18 
 
 		 406 aa  305  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125783  normal  0.298063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  47.96 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0690  ribonuclease D  41.16 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00562045  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0883  3'-5' exonuclease  45.59 
 
 		 476 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  34.57 
 
 		 382 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  31.38 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  35.44 
 
 		 294 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  29.31 
 
 		 377 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  36.1 
 
 		 296 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  28.97 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  33.55 
 
 		 392 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  35.42 
 
 		 288 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  35.07 
 
 		 288 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  31.63 
 
 		 396 aa  117  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  28.09 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  31.72 
 
 		 382 aa  113  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  29.69 
 
 		 382 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  33.47 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  32.72 
 
 		 377 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  33.85 
 
 		 394 aa  104  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  31.06 
 
 		 352 aa  103  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  33.72 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  29.02 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  33.18 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  30.8 
 
 		 295 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  34.16 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  32.35 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  32.47 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  32.47 
 
 		 377 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  33.45 
 
 		 396 aa  100  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  32.39 
 
 		 381 aa  99.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  32.95 
 
 		 384 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  30.32 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  33.06 
 
 		 384 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  31.92 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  30.19 
 
 		 381 aa  99  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  31.09 
 
 		 369 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  31.38 
 
 		 369 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  30.71 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  30.71 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  30.71 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  30.42 
 
 		 388 aa  97.1  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  28.75 
 
 		 384 aa  97.1  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  28.75 
 
 		 384 aa  97.4  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  31.4 
 
 		 369 aa  97.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  32.14 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  31.51 
 
 		 367 aa  94.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  31.38 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  28.33 
 
 		 379 aa  93.2  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  32 
 
 		 377 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  30.04 
 
 		 385 aa  91.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  31.4 
 
 		 392 aa  91.3  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  31.51 
 
 		 367 aa  91.3  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  28.72 
 
 		 381 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  30.49 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  30.49 
 
 		 385 aa  90.1  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  26.84 
 
 		 386 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  29.8 
 
 		 381 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  29.11 
 
 		 384 aa  89.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  24.65 
 
 		 385 aa  89  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  31.23 
 
 		 386 aa  89  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  28.16 
 
 		 371 aa  89  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1668  ribonuclease D  29.49 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0672  Ribonuclease D  26.1 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  31.16 
 
 		 384 aa  88.2  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  26.94 
 
 		 381 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  29.39 
 
 		 383 aa  87.8  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>