234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2381 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 407 aa  798    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  62.09 
 
 		 451 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  61.23 
 
 		 451 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  55.61 
 
 		 418 aa  408  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  57.39 
 
 		 408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  54.39 
 
 		 413 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  58.02 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  56.38 
 
 		 437 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  58.25 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1901  HRDC:3'-5' exonuclease  57.33 
 
 		 420 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  52.59 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6780  3'-5' exonuclease  53.32 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  54.48 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  54.87 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  54.26 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  54.73 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  53.23 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  53.92 
 
 		 420 aa  362  8e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1656  3'-5' exonuclease  51.26 
 
 		 449 aa  356  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.290963  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1649  3'-5' exonuclease  51.13 
 
 		 443 aa  356  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1726  3'-5' exonuclease  55.41 
 
 		 417 aa  350  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0339876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2479  3'-5' exonuclease  50.12 
 
 		 426 aa  346  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3921  3'-5' exonuclease  49.51 
 
 		 424 aa  345  8e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0599222  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1890  3'-5' exonuclease  46.62 
 
 		 404 aa  329  4e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2261  3'-5' exonuclease  50.86 
 
 		 447 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2210  3'-5' exonuclease  50.88 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2256  3'-5' exonuclease  50.88 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2199  3'-5' exonuclease  50.88 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12696  hypothetical protein  50.12 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000231151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  55.87 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  47.18 
 
 		 431 aa  309  6.999999999999999e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  48.75 
 
 		 416 aa  306  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1392  3'-5' exonuclease  46.21 
 
 		 406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125783  normal  0.298063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1962  3'-5' exonuclease  53.09 
 
 		 416 aa  302  7.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.128564  hitchhiker  0.0000452801 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0690  ribonuclease D  39.64 
 
 		 433 aa  272  9e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00562045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  44.05 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0883  3'-5' exonuclease  45.2 
 
 		 476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  35.03 
 
 		 382 aa  129  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  31.13 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  37.37 
 
 		 294 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  36.96 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  38.91 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  36.59 
 
 		 288 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  30.42 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  32.97 
 
 		 352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  30.22 
 
 		 409 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  31.19 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  29.02 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  32.72 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  31.16 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  33.66 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  29.2 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  30.29 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  35 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  37.9 
 
 		 391 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  35.51 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  33.47 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  28.83 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  35.53 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  35.53 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  33.71 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  33.33 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  35.53 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  34.31 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  28.78 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  28.78 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  28.78 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  29.36 
 
 		 368 aa  103  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  28.65 
 
 		 367 aa  102  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  29.07 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  33.55 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3068  ribonuclease D  36.1 
 
 		 385 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  33.55 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  34.8 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  27.56 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  35 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  30.88 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1971  ribonuclease D  35.68 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0679  ribonuclease D  35.68 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  28.49 
 
 		 369 aa  97.1  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  27.56 
 
 		 384 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  27.83 
 
 		 367 aa  96.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  27.56 
 
 		 384 aa  96.7  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  31.19 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  33.33 
 
 		 392 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  32.13 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  28.7 
 
 		 369 aa  93.2  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  35.71 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  29.23 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  30.66 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  31.05 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  31.05 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  31.16 
 
 		 382 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  31.38 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  30.87 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  30.77 
 
 		 375 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1890  ribonuclease D  34.27 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239057  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  30.77 
 
 		 375 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  31.63 
 
 		 385 aa  90.5  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>