226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1891 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 420 aa  803    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  70.15 
 
 		 437 aa  539  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1726  3'-5' exonuclease  72.8 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0339876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  56.78 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  59.08 
 
 		 421 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  58.99 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6780  3'-5' exonuclease  56.03 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  57.76 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  58.44 
 
 		 403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  58.76 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  56.63 
 
 		 499 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1649  3'-5' exonuclease  57.32 
 
 		 443 aa  398  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1656  3'-5' exonuclease  55.32 
 
 		 449 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.290963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1901  HRDC:3'-5' exonuclease  59.74 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1962  3'-5' exonuclease  62.57 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.128564  hitchhiker  0.0000452801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  56.04 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  57.32 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  55.4 
 
 		 451 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  53.96 
 
 		 413 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  64.23 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  56.89 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  54.03 
 
 		 416 aa  368  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  57.48 
 
 		 416 aa  353  4e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2479  3'-5' exonuclease  50.36 
 
 		 426 aa  352  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1890  3'-5' exonuclease  50.76 
 
 		 404 aa  351  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  53.38 
 
 		 407 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1392  3'-5' exonuclease  47.84 
 
 		 406 aa  345  7e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125783  normal  0.298063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3921  3'-5' exonuclease  49.38 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0599222  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2261  3'-5' exonuclease  52.3 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2210  3'-5' exonuclease  50.5 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2256  3'-5' exonuclease  50.5 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2199  3'-5' exonuclease  50.5 
 
 		 428 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10077 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0690  ribonuclease D  45.15 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00562045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12696  hypothetical protein  46.93 
 
 		 438 aa  308  9e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000231151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  48.91 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  47.41 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0883  3'-5' exonuclease  48.12 
 
 		 476 aa  242  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  33.6 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  29.22 
 
 		 382 aa  123  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  32.9 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  31.15 
 
 		 295 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  27.79 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  28.74 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  28.74 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  28.74 
 
 		 388 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  29.32 
 
 		 409 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  36.78 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  30.38 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  30.37 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  36.4 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  29.12 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  32.37 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  36.26 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  29.67 
 
 		 382 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  36.4 
 
 		 294 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  34.32 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  29.26 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  28.94 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  31 
 
 		 367 aa  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  28.57 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  28.61 
 
 		 369 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  28.61 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  28.61 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  28.65 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  28.61 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  34.46 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  29.63 
 
 		 367 aa  100  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  31.49 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  32.05 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  31.42 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  33.33 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1734  ribonuclease D  29.63 
 
 		 370 aa  96.7  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  30.58 
 
 		 392 aa  96.7  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  29.12 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  29.12 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  29.12 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  29.3 
 
 		 369 aa  95.5  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  29.12 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  29.12 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  29.12 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  29.12 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  29.12 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  29.26 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  30.03 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  30.03 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  28.53 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  34.69 
 
 		 394 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  29.74 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  29.74 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  30.03 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  33.74 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  30.36 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  32.92 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1668  ribonuclease D  27.85 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0680665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  30.57 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  26.76 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1626  ribonuclease D  28.57 
 
 		 371 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000103666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  32.73 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  34.68 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  30.93 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>