228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12696 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12696  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  856    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000231151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3921  3'-5' exonuclease  68.76 
 
 		 424 aa  557  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0599222  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2479  3'-5' exonuclease  70.28 
 
 		 426 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2210  3'-5' exonuclease  69.76 
 
 		 428 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2256  3'-5' exonuclease  69.76 
 
 		 428 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2199  3'-5' exonuclease  69.76 
 
 		 428 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  55.21 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  52.05 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  52.63 
 
 		 414 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2261  3'-5' exonuclease  52.68 
 
 		 447 aa  361  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  52.1 
 
 		 451 aa  359  5e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  51.72 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  51.8 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1890  3'-5' exonuclease  50.62 
 
 		 404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  50 
 
 		 408 aa  342  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  49.29 
 
 		 442 aa  342  8e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  52.32 
 
 		 427 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  49.16 
 
 		 421 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  50.12 
 
 		 416 aa  333  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1901  HRDC:3'-5' exonuclease  51.96 
 
 		 420 aa  331  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1649  3'-5' exonuclease  49 
 
 		 443 aa  329  6e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6780  3'-5' exonuclease  47.84 
 
 		 443 aa  328  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  51.57 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  49.02 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  49.88 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1656  3'-5' exonuclease  48.12 
 
 		 449 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.290963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  47.36 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1726  3'-5' exonuclease  50.24 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0339876 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  46.44 
 
 		 420 aa  316  6e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1392  3'-5' exonuclease  44.69 
 
 		 406 aa  305  8.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125783  normal  0.298063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  45.61 
 
 		 416 aa  299  8e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  43.78 
 
 		 431 aa  292  8e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1962  3'-5' exonuclease  48.12 
 
 		 416 aa  288  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.128564  hitchhiker  0.0000452801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  47.85 
 
 		 427 aa  270  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  43.62 
 
 		 399 aa  265  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0690  ribonuclease D  36.22 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00562045  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0883  3'-5' exonuclease  44.73 
 
 		 476 aa  210  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  32.01 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  33.47 
 
 		 352 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 294 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  28.61 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  33.11 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  27.93 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  34.29 
 
 		 296 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  27.57 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  32.96 
 
 		 288 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  33.09 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  32.4 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  33.6 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  31.99 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  32.13 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  30.52 
 
 		 385 aa  100  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  28.14 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  28.65 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  31.35 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 295 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  29.94 
 
 		 382 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  28.38 
 
 		 392 aa  97.1  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  30.95 
 
 		 377 aa  96.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  30.3 
 
 		 427 aa  96.7  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  30.65 
 
 		 399 aa  96.3  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  31.42 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  32.24 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  28.94 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  27.2 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  29.94 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  27.75 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  32.13 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  27.75 
 
 		 386 aa  94  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  29.33 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  28.66 
 
 		 384 aa  93.2  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  30.28 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  31.3 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  27.06 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  26.92 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  30.28 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  27.56 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  31.69 
 
 		 384 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  30.97 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  27.24 
 
 		 367 aa  90.9  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  29.77 
 
 		 392 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  29.06 
 
 		 382 aa  89.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  28.79 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  31.58 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  30.15 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  29.37 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  30.69 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  28.24 
 
 		 381 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  26.63 
 
 		 388 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  26.42 
 
 		 384 aa  87.4  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1890  ribonuclease D  29.46 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239057  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  30.29 
 
 		 381 aa  86.7  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  30.74 
 
 		 386 aa  86.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  29.71 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  27.46 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  28.66 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  32.27 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  28.08 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  27.22 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>