269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2343 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  79.41 
 
 		 205 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  76.47 
 
 		 205 aa  325  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  67.8 
 
 		 203 aa  283  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  68.14 
 
 		 203 aa  283  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  68.14 
 
 		 209 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  65.05 
 
 		 204 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  66.83 
 
 		 203 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  65.85 
 
 		 204 aa  276  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  67.65 
 
 		 209 aa  275  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  66.83 
 
 		 204 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  66.67 
 
 		 209 aa  274  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  65.53 
 
 		 204 aa  272  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  67.48 
 
 		 204 aa  271  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  66.5 
 
 		 204 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  65.85 
 
 		 204 aa  268  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  65.85 
 
 		 204 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  66.02 
 
 		 204 aa  267  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  66.18 
 
 		 207 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  63.9 
 
 		 204 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  64.08 
 
 		 205 aa  261  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  63.41 
 
 		 204 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  62.8 
 
 		 206 aa  260  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  62.62 
 
 		 206 aa  257  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  64.71 
 
 		 204 aa  256  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  63.41 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  62.56 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  63.9 
 
 		 204 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  60.59 
 
 		 216 aa  251  5.000000000000001e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  61.35 
 
 		 206 aa  251  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  62.93 
 
 		 204 aa  250  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  59.61 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  59.71 
 
 		 205 aa  247  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  60.2 
 
 		 206 aa  247  9e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  59.02 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  58.74 
 
 		 205 aa  244  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  59.71 
 
 		 208 aa  244  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  62.02 
 
 		 218 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  58.25 
 
 		 205 aa  241  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  57.77 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  55.83 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  55.83 
 
 		 208 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  56.94 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  54.37 
 
 		 206 aa  228  6e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  55.83 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  55.91 
 
 		 213 aa  201  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  53.47 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  52.22 
 
 		 209 aa  197  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  51.52 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  53.4 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  53.4 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  52.33 
 
 		 209 aa  187  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  53.4 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  51.06 
 
 		 214 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  44.44 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  51.81 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  47.17 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  46.15 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  48.92 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  54.02 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  52.57 
 
 		 214 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  48.94 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  48.4 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  50 
 
 		 212 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  38.06 
 
 		 392 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  34.32 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  36.77 
 
 		 393 aa  82  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  31.03 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  31.03 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  33.73 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  31.25 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  31.89 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  29.94 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  35.26 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  32.18 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  29.94 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  32.52 
 
 		 382 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  29.31 
 
 		 385 aa  75.1  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  34.13 
 
 		 386 aa  74.7  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  31.98 
 
 		 381 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  29.89 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  31.29 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  30 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2009  ribonuclease D  36.02 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  29.89 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  32.08 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  31.25 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0300  putative ribonuclease D  31.9 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  30.73 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  33.96 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  31.87 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  32.14 
 
 		 405 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  33.54 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  29.89 
 
 		 382 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  30.67 
 
 		 381 aa  71.6  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  33.33 
 
 		 396 aa  71.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  30.97 
 
 		 405 aa  71.6  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  29.05 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  30 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  33.76 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>