259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0186 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  100 
 
 
392 aa  803    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  43 
 
 
386 aa  316  6e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0300  putative ribonuclease D  43.78 
 
 
387 aa  315  8e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  34.85 
 
 
384 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  34.07 
 
 
385 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  31.89 
 
 
388 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  34.34 
 
 
385 aa  210  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  34.34 
 
 
385 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  33.88 
 
 
382 aa  208  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  33.61 
 
 
386 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  32.14 
 
 
395 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  30.58 
 
 
405 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  33.88 
 
 
427 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  31.18 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  31.69 
 
 
384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  31.69 
 
 
384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  30.67 
 
 
395 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  32.43 
 
 
384 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  32.69 
 
 
396 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  32.14 
 
 
382 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  32.33 
 
 
394 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  32.86 
 
 
389 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  31.47 
 
 
392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  31.61 
 
 
388 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  32.69 
 
 
392 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  31.88 
 
 
382 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1752  ribonuclease D  29.89 
 
 
395 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00607213  normal  0.281233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  30.66 
 
 
393 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  30.4 
 
 
386 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  31.44 
 
 
392 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  31.27 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  38.17 
 
 
384 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  31.27 
 
 
392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  30.58 
 
 
384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  28.53 
 
 
385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  31.68 
 
 
381 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1890  ribonuclease D  27.92 
 
 
401 aa  182  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239057  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1971  ribonuclease D  30.83 
 
 
385 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  32.04 
 
 
389 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0679  ribonuclease D  30.83 
 
 
385 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  30.61 
 
 
405 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  37.15 
 
 
381 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  29.35 
 
 
386 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  29.1 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3068  ribonuclease D  30.48 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  28.33 
 
 
392 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  29.38 
 
 
379 aa  168  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0869  ribonuclease D  30.67 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  28.1 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  29.46 
 
 
381 aa  162  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  25.96 
 
 
399 aa  160  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  29.17 
 
 
384 aa  156  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  29.17 
 
 
384 aa  156  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  32.84 
 
 
369 aa  155  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  28 
 
 
379 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  28.89 
 
 
388 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  35.1 
 
 
368 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  28.61 
 
 
396 aa  153  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1734  ribonuclease D  29.21 
 
 
370 aa  152  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  29.28 
 
 
369 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  29.28 
 
 
369 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  29.28 
 
 
369 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  29.09 
 
 
369 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  28.65 
 
 
367 aa  149  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  34.21 
 
 
377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  27.32 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  26.3 
 
 
377 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  26.53 
 
 
374 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  27.46 
 
 
377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01138  ribonuclease D  28.06 
 
 
385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000796428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  26.53 
 
 
393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  33.77 
 
 
377 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  33.09 
 
 
386 aa  145  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  35.92 
 
 
400 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  27.01 
 
 
384 aa  143  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  28.4 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  25.61 
 
 
377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  27.4 
 
 
367 aa  140  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  30.83 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  30.83 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  30.83 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  30.83 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  30.83 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  31.71 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  26.65 
 
 
371 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  26.65 
 
 
371 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  26.65 
 
 
375 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  26.65 
 
 
375 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  26.65 
 
 
375 aa  136  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  26.65 
 
 
375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  26.39 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  26.39 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  26.39 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  24.44 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  26.32 
 
 
377 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0507  ribonuclease D  24.34 
 
 
374 aa  134  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00420  ribonuclease D  27.27 
 
 
363 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.966086  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  28.63 
 
 
369 aa  133  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2402  ribonuclease D  27.75 
 
 
373 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137804  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2013  ribonuclease D  27.75 
 
 
373 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000328628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>