201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC03940 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC03940  PM-scl autoantigen, putative  100 
 
 		 1016 aa  2104    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05001  exosome complex exonuclease Rrp6, putative (Eurofung)  35.91 
 
 		 1297 aa  325  3e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333756  normal  0.453331 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68661  ribosomal RNA processing 3'-5' exonuclease  38.52 
 
 		 792 aa  273  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39090  predicted protein  52.3 
 
 		 176 aa  199  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22703  predicted protein  34.97 
 
 		 311 aa  159  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0386585  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  31.23 
 
 		 295 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  30.96 
 
 		 382 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  32.38 
 
 		 382 aa  121  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  33.21 
 
 		 377 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  45.33 
 
 		 375 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  33.21 
 
 		 377 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  36.42 
 
 		 382 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  39.01 
 
 		 381 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45692  predicted protein  37.16 
 
 		 700 aa  110  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  36.69 
 
 		 409 aa  110  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  35.84 
 
 		 294 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  36.9 
 
 		 288 aa  107  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  36.9 
 
 		 288 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  34.22 
 
 		 381 aa  107  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  35.75 
 
 		 296 aa  96.3  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  30.88 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  33.01 
 
 		 385 aa  76.6  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  27.57 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  30.77 
 
 		 392 aa  74.3  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0300  putative ribonuclease D  26.06 
 
 		 387 aa  73.2  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  24.58 
 
 		 396 aa  73.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  26.06 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  28.24 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  30.32 
 
 		 352 aa  70.5  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  30.54 
 
 		 382 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  30.51 
 
 		 384 aa  69.7  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  29.55 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  29.82 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  28.49 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  30.51 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  27.65 
 
 		 381 aa  67.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  30.19 
 
 		 389 aa  67.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  28.16 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  29.44 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  27.64 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  28.57 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  30.41 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  29.52 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  29.88 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  30.99 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  29.59 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  30.99 
 
 		 385 aa  63.9  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01138  ribonuclease D  26.95 
 
 		 385 aa  63.9  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000796428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  27.68 
 
 		 379 aa  63.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  29.38 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  30.32 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  29.05 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  25.73 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  24.56 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  28.25 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  31.33 
 
 		 386 aa  62  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0869  ribonuclease D  27.49 
 
 		 391 aa  62  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  26.19 
 
 		 451 aa  62  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  30.86 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0507  ribonuclease D  26.2 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  33.33 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  30.86 
 
 		 384 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  27.92 
 
 		 499 aa  61.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2009  ribonuclease D  25.47 
 
 		 403 aa  60.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2759  ribonuclease D  25.6 
 
 		 390 aa  60.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000108089  hitchhiker  0.00170183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  28.99 
 
 		 381 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  26.98 
 
 		 374 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  26.97 
 
 		 368 aa  60.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  29.61 
 
 		 382 aa  60.1  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  25 
 
 		 386 aa  60.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  29.07 
 
 		 371 aa  60.1  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  25.71 
 
 		 451 aa  60.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  30.86 
 
 		 384 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5140  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.81 
 
 		 648 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.76274e-16 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  31.25 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  29.44 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  27.93 
 
 		 384 aa  59.7  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3922  ribonuclease D  26.19 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  28.89 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  28.89 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1971  ribonuclease D  30.34 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0679  ribonuclease D  30.34 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  28.81 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  28.89 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  27.32 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  30.72 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  26.43 
 
 		 413 aa  57.4  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  28.22 
 
 		 392 aa  57  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1734  ribonuclease D  28.65 
 
 		 370 aa  56.6  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  26.35 
 
 		 381 aa  57  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2531  ribonuclease D  30.41 
 
 		 384 aa  56.6  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  26.32 
 
 		 377 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  25.73 
 
 		 369 aa  56.2  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  29.3 
 
 		 399 aa  56.2  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  28.99 
 
 		 383 aa  56.2  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  26.7 
 
 		 386 aa  55.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  27.04 
 
 		 427 aa  55.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  28.66 
 
 		 400 aa  55.1  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  24.55 
 
 		 382 aa  55.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1656  3'-5' exonuclease  27.5 
 
 		 449 aa  55.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.290963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>