230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_39090 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009366  OSTLU_39090  predicted protein  100 
 
 		 176 aa  360  6e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967738  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03940  PM-scl autoantigen, putative  52.3 
 
 		 1016 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05001  exosome complex exonuclease Rrp6, putative (Eurofung)  46.82 
 
 		 1297 aa  178  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333756  normal  0.453331 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68661  ribosomal RNA processing 3'-5' exonuclease  47.59 
 
 		 792 aa  171  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22703  predicted protein  39.15 
 
 		 311 aa  149  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0386585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  41.18 
 
 		 382 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  37.27 
 
 		 295 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  42.33 
 
 		 381 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  40.36 
 
 		 294 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  40.36 
 
 		 288 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  40.36 
 
 		 288 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  36.81 
 
 		 296 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  34.86 
 
 		 382 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  37.28 
 
 		 382 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  39.51 
 
 		 375 aa  97.8  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  37.65 
 
 		 377 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  36.84 
 
 		 377 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  37.8 
 
 		 381 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  34.48 
 
 		 409 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45692  predicted protein  36.69 
 
 		 700 aa  92  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  35.71 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  34.01 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  30.25 
 
 		 392 aa  74.3  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  28.31 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  26.09 
 
 		 399 aa  68.2  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  28.05 
 
 		 405 aa  67.8  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  29.09 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0300  putative ribonuclease D  30.64 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1752  ribonuclease D  28.31 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00607213  normal  0.281233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  30.18 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  30.25 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  27.88 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  28.83 
 
 		 377 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  27.88 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  27.88 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  27.88 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  30.91 
 
 		 392 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  30 
 
 		 384 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  27.88 
 
 		 375 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  29.07 
 
 		 385 aa  65.5  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  31.03 
 
 		 385 aa  65.1  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  28.75 
 
 		 382 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  29.81 
 
 		 396 aa  64.7  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  29.07 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  28.12 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  32.24 
 
 		 582 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  29.17 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  28.75 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  28.75 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  29.41 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  27.27 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0736  ribonuclease D  27.22 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0989413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2009  ribonuclease D  26.95 
 
 		 403 aa  62.4  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  28.82 
 
 		 386 aa  61.6  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  31.76 
 
 		 377 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  32 
 
 		 377 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  28.12 
 
 		 384 aa  61.6  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  31.76 
 
 		 377 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  30.82 
 
 		 377 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  28.22 
 
 		 379 aa  61.2  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  27.88 
 
 		 375 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  27.88 
 
 		 375 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  27.88 
 
 		 375 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  27.88 
 
 		 375 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  27.88 
 
 		 375 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  27.88 
 
 		 375 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  28.07 
 
 		 385 aa  60.8  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  25.6 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  27.78 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  27.27 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  28.65 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  27.98 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  27.44 
 
 		 371 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  30.11 
 
 		 399 aa  59.3  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  27.78 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  27.44 
 
 		 371 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  28.09 
 
 		 405 aa  58.9  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  34.91 
 
 		 427 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2964  3'-5' exonuclease  26.35 
 
 		 308 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  27.98 
 
 		 395 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  29.94 
 
 		 394 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2232  ribonuclease D  25.16 
 
 		 374 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000142967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  31.25 
 
 		 418 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2088  ribonuclease D  30.2 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  27.12 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01138  ribonuclease D  24.85 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000796428  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  29.52 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  25.15 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  26.74 
 
 		 427 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  28.38 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1563  ribonuclease D  28.95 
 
 		 377 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459041  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  31.07 
 
 		 437 aa  55.5  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  29.11 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  26.54 
 
 		 384 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2009  ribonuclease D  30.2 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  27.56 
 
 		 393 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  29.89 
 
 		 442 aa  55.1  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  25.77 
 
 		 400 aa  55.1  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1937  ribonuclease D  24.85 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  28.48 
 
 		 381 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>