173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2964 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2964  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 308 aa  627  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0668  3'-5' exonuclease  48.66 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.562548  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5140  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.09 
 
 		 648 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.76274e-16 
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  29.79 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  33.33 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  32.68 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  28.48 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  27.54 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  31.87 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  30.25 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  30.82 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  29.27 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  28.28 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  27.49 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  28.57 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  26.4 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  29.14 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  30 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  29.76 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  29.27 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  30.63 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  27.38 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  29.76 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39090  predicted protein  26.35 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  26.4 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  25.99 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  29.59 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  29.75 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  24.69 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  29.11 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  27.23 
 
 		 204 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  28.48 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  28.48 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  26.44 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  27.23 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  28.24 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  25.66 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  31.82 
 
 		 925 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  24.69 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  24.67 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  24.69 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  24.69 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  29.11 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  30.17 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  30.52 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  25.41 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1064  ribonuclease D (rnase d)  27.36 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409138  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  31.17 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  27.52 
 
 		 204 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  28.57 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  28.65 
 
 		 385 aa  53.9  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  29.09 
 
 		 206 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  31.33 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  26.63 
 
 		 385 aa  53.9  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  30.14 
 
 		 205 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  27.85 
 
 		 203 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  28.57 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  24.29 
 
 		 381 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  30.12 
 
 		 205 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  28.72 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  26.42 
 
 		 386 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  30.46 
 
 		 550 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  29.44 
 
 		 427 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  24.34 
 
 		 384 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  24.92 
 
 		 384 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  27.81 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  26.95 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  26.95 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  26.63 
 
 		 385 aa  52.8  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  24.25 
 
 		 367 aa  52.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  27.11 
 
 		 582 aa  52.8  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  26.15 
 
 		 204 aa  52.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  28.14 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  26.27 
 
 		 367 aa  52.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  31.17 
 
 		 925 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  29.87 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  27.08 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68661  ribosomal RNA processing 3'-5' exonuclease  24.19 
 
 		 792 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  26.09 
 
 		 385 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  30.87 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1890  3'-5' exonuclease  26.62 
 
 		 404 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  30.69 
 
 		 583 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  28.48 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  31.29 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  27.22 
 
 		 203 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  26.71 
 
 		 392 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  30.87 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  23.04 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1994  ribonuclease D  24.49 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  28.85 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  26.82 
 
 		 205 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  24.59 
 
 		 400 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  33.55 
 
 		 213 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  23.76 
 
 		 382 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  24.18 
 
 		 394 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  23.66 
 
 		 375 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  23.61 
 
 		 381 aa  50.1  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  27.32 
 
 		 395 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  30.87 
 
 		 211 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2531  ribonuclease D  24.23 
 
 		 384 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>