274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0196 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  70.44 
 
 		 204 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  68.97 
 
 		 204 aa  304  6e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  69.46 
 
 		 204 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  69.46 
 
 		 204 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  67.98 
 
 		 204 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  68.97 
 
 		 204 aa  296  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  68.97 
 
 		 203 aa  294  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  68.97 
 
 		 204 aa  291  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  69.15 
 
 		 207 aa  289  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  65.85 
 
 		 206 aa  289  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  66.67 
 
 		 209 aa  287  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  67.32 
 
 		 206 aa  285  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  67.16 
 
 		 204 aa  285  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  67 
 
 		 203 aa  284  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  66.67 
 
 		 204 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  68.14 
 
 		 205 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  65.69 
 
 		 205 aa  282  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  66.67 
 
 		 204 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  65.52 
 
 		 204 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  65.67 
 
 		 209 aa  280  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  65.37 
 
 		 206 aa  280  8.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  66.34 
 
 		 209 aa  278  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  65.2 
 
 		 204 aa  277  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  62.07 
 
 		 204 aa  275  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  64.65 
 
 		 206 aa  270  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  65.2 
 
 		 205 aa  269  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  63.55 
 
 		 204 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  62.07 
 
 		 204 aa  262  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  59.8 
 
 		 206 aa  261  3e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  63.24 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  62.8 
 
 		 218 aa  261  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  62.87 
 
 		 210 aa  259  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  59.61 
 
 		 204 aa  258  4e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  57.84 
 
 		 205 aa  257  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  59.7 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  57.84 
 
 		 205 aa  253  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  57.35 
 
 		 205 aa  251  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  60.4 
 
 		 206 aa  251  7e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  58.62 
 
 		 208 aa  250  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  58.54 
 
 		 206 aa  244  6e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  57.35 
 
 		 205 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  56.52 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  56.04 
 
 		 208 aa  238  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  55.56 
 
 		 208 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  60.33 
 
 		 213 aa  224  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  53.19 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  53.19 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  51.6 
 
 		 209 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  51.6 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  53.23 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  53.23 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  50.54 
 
 		 211 aa  184  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  48.5 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  48.17 
 
 		 214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  43.69 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  48.11 
 
 		 211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  51.45 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  47.57 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  51.45 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  47.57 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  44.79 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  44.27 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  49.68 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  38.31 
 
 		 392 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  34.42 
 
 		 405 aa  88.6  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  30.17 
 
 		 381 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  38.36 
 
 		 550 aa  88.2  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  29.83 
 
 		 384 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  32.22 
 
 		 385 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  32.22 
 
 		 385 aa  86.7  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  33.94 
 
 		 393 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  33.12 
 
 		 389 aa  85.9  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  31.11 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  34.48 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  30.3 
 
 		 375 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  36.13 
 
 		 395 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  28.49 
 
 		 381 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  33.33 
 
 		 382 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  36.23 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  34.87 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  32.48 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  33.1 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  30.86 
 
 		 392 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  31.41 
 
 		 382 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  31.74 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  34.18 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  32.05 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  33.1 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  29.61 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  33.1 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  31.98 
 
 		 381 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  33.1 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  30.41 
 
 		 382 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  31.82 
 
 		 396 aa  74.7  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2531  ribonuclease D  34.04 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  33.33 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  30.13 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  30.26 
 
 		 583 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  30.38 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>