242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_17921 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  96.68 
 
 		 211 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  92.89 
 
 		 211 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  76.19 
 
 		 213 aa  333  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  62.23 
 
 		 214 aa  251  6e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  58.25 
 
 		 214 aa  250  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  61.7 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  56.57 
 
 		 214 aa  249  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  55.28 
 
 		 214 aa  248  7e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  55.05 
 
 		 211 aa  241  7.999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  57.58 
 
 		 207 aa  238  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  54.25 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  55.12 
 
 		 209 aa  235  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  54.55 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  54.55 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  53.03 
 
 		 217 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  51.71 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  52.43 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  48.98 
 
 		 204 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  49 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  48.47 
 
 		 203 aa  188  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  49.49 
 
 		 204 aa  187  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  48.47 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  43.19 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  49.21 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  48.47 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  51.89 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  48.98 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  46.07 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  46.19 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  48.7 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  48.11 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  41.31 
 
 		 209 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  41.78 
 
 		 209 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  49.49 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  45.18 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  46.03 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  45.18 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  48.65 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  46.94 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  46.15 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  46.01 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  45.55 
 
 		 204 aa  175  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  44.04 
 
 		 205 aa  174  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  44.16 
 
 		 204 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  44.44 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  44.88 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  46.27 
 
 		 218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  48.11 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  46.24 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  47.57 
 
 		 208 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  45.45 
 
 		 205 aa  167  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  43.07 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  44.68 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  45.41 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  45.96 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  43.07 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  45.95 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  45.95 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  43.37 
 
 		 204 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  47.03 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  42.7 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  32.52 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  30.6 
 
 		 550 aa  79.7  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  30.95 
 
 		 382 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  31.67 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  31.32 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  29.24 
 
 		 382 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  32.08 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  32.93 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  32.35 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  29.94 
 
 		 396 aa  71.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  30.54 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  29.12 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  31.18 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  33.57 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  30.19 
 
 		 381 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  29.89 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  30.97 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  29.56 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  29.81 
 
 		 385 aa  65.9  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1752  ribonuclease D  31.72 
 
 		 395 aa  65.9  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00607213  normal  0.281233 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  29.81 
 
 		 385 aa  65.5  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  27.62 
 
 		 385 aa  64.7  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6686  Ribonuclease D  32 
 
 		 400 aa  64.7  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  27.89 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  31.25 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  28.32 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  29.7 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  27.78 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0300  putative ribonuclease D  32.65 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  29.56 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  30 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  27.5 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  29.37 
 
 		 394 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1734  ribonuclease D  32.12 
 
 		 370 aa  62  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  31.94 
 
 		 399 aa  61.6  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>