265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0171 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  86.41 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  82.04 
 
 		 204 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  82.52 
 
 		 204 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  82.04 
 
 		 204 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  80.58 
 
 		 204 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  78.16 
 
 		 204 aa  334  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  70.73 
 
 		 204 aa  298  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  69.71 
 
 		 206 aa  296  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  69.27 
 
 		 208 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  68.29 
 
 		 208 aa  292  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  68.78 
 
 		 208 aa  290  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  70.73 
 
 		 209 aa  290  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  66.99 
 
 		 204 aa  290  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  66.99 
 
 		 205 aa  289  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  70.73 
 
 		 209 aa  288  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  66.5 
 
 		 205 aa  287  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  67.32 
 
 		 208 aa  287  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  70.05 
 
 		 204 aa  287  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  68.93 
 
 		 207 aa  286  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  66.67 
 
 		 205 aa  285  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  66.02 
 
 		 205 aa  285  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  70.87 
 
 		 209 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  65.37 
 
 		 203 aa  280  9e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  63.9 
 
 		 203 aa  277  8e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  66.5 
 
 		 204 aa  275  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  65.22 
 
 		 204 aa  274  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  65.37 
 
 		 203 aa  274  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  64.73 
 
 		 204 aa  272  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  64.56 
 
 		 206 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  64.73 
 
 		 204 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  64.56 
 
 		 204 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  64.56 
 
 		 204 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  63.46 
 
 		 205 aa  261  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  63.24 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  61.35 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  63.59 
 
 		 205 aa  251  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  61.35 
 
 		 205 aa  251  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  59.31 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  60.87 
 
 		 205 aa  248  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  61.72 
 
 		 218 aa  247  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  53.4 
 
 		 204 aa  235  4e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  54.41 
 
 		 216 aa  234  7e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  55.12 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  55.72 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  51.92 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  54.35 
 
 		 209 aa  201  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  51.5 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  52 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  51.5 
 
 		 209 aa  197  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  51.5 
 
 		 210 aa  197  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  52 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  47.34 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  53.49 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  51.32 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  46.95 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  47 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  46.01 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  45.54 
 
 		 211 aa  174  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  45.15 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  47.19 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  46.63 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  51.38 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  37.95 
 
 		 550 aa  95.9  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  33.72 
 
 		 389 aa  94.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  34.07 
 
 		 386 aa  92.8  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  35.06 
 
 		 395 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  34.86 
 
 		 392 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  31.58 
 
 		 381 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  32.3 
 
 		 385 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  36.84 
 
 		 392 aa  89.7  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  37.91 
 
 		 393 aa  89.4  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  31.74 
 
 		 385 aa  88.6  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  35.33 
 
 		 405 aa  88.6  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  33.99 
 
 		 384 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  31.58 
 
 		 381 aa  87.8  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  33.99 
 
 		 384 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  33.99 
 
 		 384 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  33.54 
 
 		 385 aa  86.7  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  32.47 
 
 		 386 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  31.58 
 
 		 384 aa  85.5  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  34.19 
 
 		 388 aa  85.5  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  31.46 
 
 		 392 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  31.82 
 
 		 389 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  31.15 
 
 		 394 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  32.16 
 
 		 385 aa  82  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  32.16 
 
 		 385 aa  81.6  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  30.9 
 
 		 382 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  32.39 
 
 		 381 aa  81.3  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  34.9 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2762  ribonuclease D  36.05 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  30.34 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  33.33 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  30.99 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2009  ribonuclease D  37.27 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.815664  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  37.96 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  31.1 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1890  ribonuclease D  31.4 
 
 		 401 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239057  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  32.5 
 
 		 392 aa  77.8  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>