263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0228 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 203 aa  421  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  75.86 
 
 		 204 aa  333  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  72.91 
 
 		 203 aa  317  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  73.53 
 
 		 204 aa  310  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  68.97 
 
 		 204 aa  297  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  71.08 
 
 		 204 aa  296  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  71.08 
 
 		 204 aa  296  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  68.97 
 
 		 204 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  68.97 
 
 		 203 aa  294  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  65.83 
 
 		 209 aa  294  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  67.98 
 
 		 204 aa  294  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  67.98 
 
 		 204 aa  293  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  70.1 
 
 		 204 aa  292  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  66.5 
 
 		 204 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  65.33 
 
 		 209 aa  291  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  64.82 
 
 		 209 aa  288  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  67.8 
 
 		 205 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  66.01 
 
 		 204 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  65.37 
 
 		 206 aa  281  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  67 
 
 		 204 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  65.85 
 
 		 206 aa  277  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  63.9 
 
 		 206 aa  277  8e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  62.87 
 
 		 207 aa  276  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  62.07 
 
 		 204 aa  275  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  67.32 
 
 		 205 aa  274  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  63.05 
 
 		 204 aa  271  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  61.08 
 
 		 204 aa  269  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  66.3 
 
 		 208 aa  267  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  64.67 
 
 		 208 aa  264  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  64.22 
 
 		 205 aa  264  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  65.22 
 
 		 208 aa  261  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  60 
 
 		 205 aa  260  8.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  60 
 
 		 205 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  61.35 
 
 		 205 aa  258  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  62.32 
 
 		 218 aa  258  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  59.51 
 
 		 205 aa  258  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  60.78 
 
 		 205 aa  257  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  63.59 
 
 		 208 aa  257  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  62.63 
 
 		 206 aa  254  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  62 
 
 		 206 aa  254  6e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  60.3 
 
 		 216 aa  251  6e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  59.8 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  59.3 
 
 		 206 aa  246  1e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  56.78 
 
 		 204 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  57.35 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  56.22 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  52.94 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  55.61 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  54.59 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  54.05 
 
 		 209 aa  201  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  51.89 
 
 		 207 aa  197  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  51.35 
 
 		 210 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  51.35 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  48.04 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  50.86 
 
 		 214 aa  184  6e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  48.94 
 
 		 214 aa  184  8e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  46.43 
 
 		 211 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  46.19 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  42.93 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  46.49 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  45.18 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  43 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  42.51 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  47.4 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  38.27 
 
 		 392 aa  98.2  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  36.99 
 
 		 393 aa  97.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  38.99 
 
 		 550 aa  92.8  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  32 
 
 		 405 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  32.95 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  29.3 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1589  ribonuclease D  30 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  29.01 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  30.06 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  30.64 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  33.33 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  30.64 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  29.34 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  30.06 
 
 		 385 aa  79  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  30.06 
 
 		 384 aa  79  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  34 
 
 		 375 aa  78.2  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  31.29 
 
 		 392 aa  78.2  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  28.32 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  30.38 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  28.49 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  28.74 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  28.89 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  33.76 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  30.97 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  33.33 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  33.33 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  33.55 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  33.33 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  33.33 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  33.33 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  33.33 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  29.34 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  28.9 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  28.33 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  28.31 
 
 		 375 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>