254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0678 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  62.44 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  63.16 
 
 		 217 aa  278  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  61.95 
 
 		 210 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  61.46 
 
 		 209 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  63.41 
 
 		 209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  60.19 
 
 		 207 aa  272  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  63.9 
 
 		 209 aa  271  4.0000000000000004e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  59.81 
 
 		 214 aa  260  1e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  57.14 
 
 		 214 aa  251  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  54.9 
 
 		 214 aa  250  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  56.57 
 
 		 211 aa  244  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  54.85 
 
 		 214 aa  241  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  54.85 
 
 		 214 aa  241  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  55.05 
 
 		 211 aa  241  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  51.66 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  50.99 
 
 		 213 aa  232  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  59.12 
 
 		 212 aa  215  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  54.9 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  52.94 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  52.94 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  53.68 
 
 		 204 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  52.2 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  52.2 
 
 		 203 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  52.45 
 
 		 204 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  51.96 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  53.47 
 
 		 205 aa  199  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  50.72 
 
 		 204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  49.77 
 
 		 209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  53.03 
 
 		 206 aa  197  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  55.85 
 
 		 204 aa  197  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  50.72 
 
 		 204 aa  197  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  50.49 
 
 		 204 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  52.94 
 
 		 205 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  52.82 
 
 		 208 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  51.53 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  50.75 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  49.76 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  53.76 
 
 		 204 aa  191  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  52.36 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  49.76 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  52.11 
 
 		 208 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  53.76 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  49.49 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  53.76 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  49.27 
 
 		 204 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  49.49 
 
 		 209 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  49.74 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  52.97 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  51.61 
 
 		 206 aa  184  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  49.74 
 
 		 205 aa  184  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  50.54 
 
 		 203 aa  184  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  49.29 
 
 		 218 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  49.03 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  47.6 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  50.49 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  51.05 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  49.21 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  49.74 
 
 		 205 aa  181  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  46.94 
 
 		 204 aa  179  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  50.86 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  34.07 
 
 		 393 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  36.09 
 
 		 392 aa  86.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  33.52 
 
 		 381 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  30.93 
 
 		 550 aa  85.9  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  31.87 
 
 		 389 aa  84.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  32.02 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  35.26 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  32.02 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  33.15 
 
 		 582 aa  82  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  32.9 
 
 		 405 aa  82  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  33.73 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  36.05 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  32.16 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  30.38 
 
 		 395 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1752  ribonuclease D  32.1 
 
 		 395 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00607213  normal  0.281233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  38.3 
 
 		 392 aa  79  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3455  ribonuclease D  29.67 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111852  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  32.53 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  32.08 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  30.11 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  34.88 
 
 		 375 aa  75.9  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  30.9 
 
 		 385 aa  75.5  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  32.08 
 
 		 385 aa  75.5  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  30.12 
 
 		 382 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  31.21 
 
 		 382 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  34.3 
 
 		 371 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  34.3 
 
 		 371 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  34.3 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  34.3 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  34.3 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  34.3 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  34.3 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0601  DNA-directed DNA polymerase  29.82 
 
 		 587 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  31.45 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  31.1 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  30.57 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>