215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1914 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 209 aa  430  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  83.25 
 
 		 209 aa  364  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  71.98 
 
 		 207 aa  324  6e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  71.01 
 
 		 210 aa  320  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  71.01 
 
 		 210 aa  320  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  67.46 
 
 		 209 aa  300  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  68.29 
 
 		 217 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  63.41 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  62.44 
 
 		 214 aa  268  5.9999999999999995e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  60.49 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  55.88 
 
 		 214 aa  248  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  57.84 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  57.35 
 
 		 214 aa  241  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  54.25 
 
 		 211 aa  237  8e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  53.77 
 
 		 211 aa  237  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  55.56 
 
 		 211 aa  234  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  52 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  62.64 
 
 		 212 aa  224  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  56.91 
 
 		 204 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  54.5 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  55.85 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  55.32 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  55.32 
 
 		 204 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  53.5 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  55.32 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  54.26 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  54.59 
 
 		 203 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  55.85 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  54.59 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  54.35 
 
 		 206 aa  201  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  53.19 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  51.55 
 
 		 204 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  53.23 
 
 		 204 aa  198  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  54.3 
 
 		 206 aa  198  6e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  52.38 
 
 		 204 aa  197  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  50.49 
 
 		 208 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  52.66 
 
 		 204 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  52 
 
 		 208 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  52.94 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  51.87 
 
 		 204 aa  194  5.000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  52.13 
 
 		 204 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  50.78 
 
 		 206 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  51.31 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  51.31 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  51.23 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  52.15 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  50.79 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  50.26 
 
 		 209 aa  191  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  51.56 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  50.5 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  49.76 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  49.51 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  53.4 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  50 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  51.3 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  49.48 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  50.26 
 
 		 205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  51.61 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  48.4 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  49.76 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  50.27 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  48.13 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  33.53 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  31.89 
 
 		 381 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  33.73 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  38.13 
 
 		 389 aa  78.2  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  34.88 
 
 		 550 aa  75.1  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  31.61 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  32.95 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2334  ribonuclease D  31.35 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  32.34 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  32.69 
 
 		 394 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  33.13 
 
 		 427 aa  72  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  31.64 
 
 		 393 aa  72  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  29.89 
 
 		 385 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1734  ribonuclease D  35.23 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  30.98 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  32.69 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  31.28 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  33.53 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  30.72 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  30.98 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  31.76 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  31.76 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  31.61 
 
 		 382 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  29.94 
 
 		 382 aa  68.2  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  34.19 
 
 		 386 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  34.91 
 
 		 386 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  30.46 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  28.98 
 
 		 582 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  30.41 
 
 		 583 aa  65.1  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  35.1 
 
 		 405 aa  65.5  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  31.35 
 
 		 375 aa  65.1  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  31.06 
 
 		 405 aa  65.1  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  31.18 
 
 		 384 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  32.37 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  33.55 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  29.1 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>